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扁吻鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析
引用本文:郝卓然,梁利群,常玉梅,任波.扁吻鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析[J].华北农学报,2012(Z1):40-45.
作者姓名:郝卓然  梁利群  常玉梅  任波
作者单位:中国水产科学院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院
基金项目:国家“863”计划项目(2007AA10Z186);水产分子育种共性技术的建立与应用项目(200903045)
摘    要:通过磁珠富集法筛选扁吻鱼的微卫星分子标记。利用限制性内切酶Sau3AI对扁吻鱼的基因组DNA进行酶切,并选取片段大小在250~750 bp间的片段,利用PCR技术进行全基因组扩增,采用生物素标记的(CA)8探针对微卫星片段进行富集。富集后的片段与T载体连接后利用DH5α大肠杆菌进行转化,然后以Sau3AI为引物对菌落进行PCR扩增,扩增后选片段大小符合条件的菌落挑取至测序板,进行测序。结果表明:PCR筛选共获得563个阳性克隆,其中测序192个阳性克隆后发现有53个微卫星序列;序列分析表明,完美型占67.92%,非完美型为22.64%;混合性标记占9.43%。根据测序结果设计微卫星引物24对,经PCR扩增筛选,琼脂糖凝胶电泳结果显示,其中22对引物可扩增出清晰的条带,其中具有多态性的13对。利用13对多态性引物对扁吻鱼野生群体进行扩增,PCR扩增结果显示,等位基因数为3~6,多态信息含量(PIC)为0.625 3,12个位点处于高度多态水平(PIC>0.5)。

关 键 词:扁吻鱼  微卫星  分子标记
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