| 外排泵基因在志贺菌分子分类中的应用 |
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| 引用本文： | 穆瑞瑞,张家洋,鲜靖苹,吴 健.外排泵基因在志贺菌分子分类中的应用[J].西北农业学报,2011,20(5):17-24. |
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| 作者姓名： | 穆瑞瑞 张家洋 鲜靖苹 吴 健 |
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| 作者单位： | 1. 新乡学院生命科学与技术系,河南新乡,453000
2. 郑州大学生物工程系,郑州,450001 |
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| 基金项目： | 河南省创新人才基金资助项目 |
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| 摘 要： | 志贺菌属(Shigellae)是感染性腹泻的重要病原菌之一,志贺菌H24是临床多耐药株.在H24的分类过程中,发现血清分型和16S rRNA分类都有一定的局限性,16S rRNA不能直接把H24鉴定至种,通过分析H24外排泵基因emrE、cmr、ydhE、acrB基因序列信息,尝试利用外排泵的基因序列信息对志贺菌进行鉴定分类.结果表明,H24外排泵基因emrE、cmr、acrB和ydhE具有很强的进化保守性,未发现染色体上的外排泵基因在不同种属之间有明显的水平转移痕迹,对志贺菌仅用16S rRNA基因序列信息连属的分类都不能做到,但结合emrE和cmr的基因序列信息可直接将志贺菌鉴定到种,首次提出以外排泵基因为分子靶标对志贺菌和大肠杆菌进行快速分类的方法.
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| 关 键 词： | 志贺菌 外排泵基因 水平转移 分类 |
Apply Multidrug Resistance Pump Genes for Molecular Taxonomy of Shigella |
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| MU Ruirui,ZHANG Jiayang,XIAN Jingping and WU Jian.Apply Multidrug Resistance Pump Genes for Molecular Taxonomy of Shigella[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2011,20(5):17-24. |
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| Authors: | MU Ruirui ZHANG Jiayang XIAN Jingping and WU Jian |
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| Institution: | MU Ruirui1,ZHANG Jiayang1,XIAN Jingping1 and WU Jian2 (1.Department of Life Science and Biotechnology,Xinxiang College,Xinxiang Henan 453000,China,2.Department of Bioengineering,Zhengzhou University,Zhengzhou 450001,China) |
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| Abstract: | Shigella is one of the most important pathogens responsible for infectious diarrhea,H24 is a clinical MDR of Shigella spp.In the process of classification of MDR Shigella spp.H24,we found that serotype and 16S rRNA classification have certain limitations,and H24 can not be identified only by sequence analysis of 16S rRNA gene.So we tried to classify Shigella spp.H24 via the sequence analysis of multiple drug-resistance pump genes emrE,cmr,ydhE and acrB.The results showed that genes of emrE,cmr,acrB and ydhE... |
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| Keywords: | Shigella Efflux pump Lateral transfer Classification |
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