| 广西水稻地方品种核心种质芽期耐盐性全基因组关联分析 |
| |
| 引用本文： | 夏秀忠,张宗琼,杨行海,荘洁,曾宇,邓国富,宋国显,黄欲晓,农保选,李丹婷.广西水稻地方品种核心种质芽期耐盐性全基因组关联分析[J].作物学报,2022(8):2007-2015. |
| |
| 作者姓名： | 夏秀忠 张宗琼 杨行海 荘洁 曾宇 邓国富 宋国显 黄欲晓 农保选 李丹婷 |
| |
| 作者单位： | 1. 广西农业科学院水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室;2. 广西农业科学院;3. 钦州市农业科学研究所 |
| |
| 摘 要： | 水稻属盐敏感的作物,盐胁迫会导致产量显著减少。我国盐渍地总面积大,并且呈迅速增长趋势,因此,筛选水稻耐盐种质,培育耐盐水稻品种十分必要。本研究在1.5%NaCl盐胁迫条件下评价419份广西水稻地方品种核心种质种子芽期的相对盐害率,并利用全基因组关联分析鉴定耐盐位点。研究结果表明:盐胁迫下,种子芽期平均发芽率为57.67%,显著低于对照92.55%,且夏皮罗-威尔克检验(0.9301)不符合正态分布。基于208,993个SNP标记,将419份核心种质资源分为6个亚群,利用一般线性模型(general linear model, GLM)和混合线性模型(mixed linear model,MLM)分析分别获得129个和1个显著关联SNP,分布在1号、2号、3号、4号、5号、6号、8号、9号和12号染色体上。在14个与水稻耐盐性显著关联区域,有13个区域与前人定位或克隆的耐盐基因重叠。显著关联区域Chr. 8:10,564,948～10,733,175为首次报道,命名为qGR8。qGR8区域内含有53个基因,其中34个经转录组数据比对获得表达谱,比对结果推测LOC＿Os08g17370为候...
|
| 关 键 词： | 水稻 核心种质 芽期 耐盐 全基因组关联分析 |
|
|
