| 禽波氏杆菌外膜蛋白A的克隆测序与生物信息分析 |
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| 引用本文： | 谭燕玲,朱瑞良,王慧,王新建,魏凯,孙振红,盛鹏程.禽波氏杆菌外膜蛋白A的克隆测序与生物信息分析[J].畜牧兽医学报,2011,42(4). |
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| 作者姓名： | 谭燕玲 朱瑞良 王慧 王新建 魏凯 孙振红 盛鹏程 |
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| 作者单位： | 山东农业大学动物科技学院,山东省动物生物技术与疫病防治重点实验室,泰安,271018 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30972183;30670114;30740077); 山东省自然科学基金项目(Y2006D09) |
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| 摘 要： | 本文旨在克隆禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA的编码基因,并预测OmpA蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA在免疫保护中所起的作用。作者对禽波氏杆菌的外膜蛋白ompA基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件和方法,对禽波氏杆菌OmpA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。禽波氏杆菌ompA基因全长597bp,编码199个氨基酸。二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和β-片层,少见β-转角;推测OmpA蛋白有5个B细胞优势抗原表位区域、2个糖基化位点。本研究为进一步分析禽波氏杆菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础。
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| 关 键 词： | 禽波氏杆菌 外膜蛋白A 二级结构 B细胞抗原表位 预测 |
Cloning,Sequencing,Secondary Structure and B-cell Epitopes Prediction of Bordetella avium Outer Membrane Protein OmpA |
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| TAN Yan-ling,ZHU Rui-liang,WANG Hui,WANG Xi-jian,WEI Kai,SUN Zhen-hong,SHENG Peng-cheng.Cloning,Sequencing,Secondary Structure and B-cell Epitopes Prediction of Bordetella avium Outer Membrane Protein OmpA[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2011,42(4). |
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| Authors: | TAN Yan-ling ZHU Rui-liang WANG Hui WANG Xi-jian WEI Kai SUN Zhen-hong SHENG Peng-cheng |
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| Abstract: | The aims of this study was to clone and sequence the ompA gene of Bordetella avium,and predict its secondary structure and B-cell epitopes,which provides a theoretical basis for the study of immune mechanism and B.avium subunit vaccine.The B.avium ompA gene was amplified,cloned,and sequenced.By using bioinformatics softwares and methods,the secondary structure and B-cell preponderant epitope of B.avium OmpA were predicted.The results indicated that B.avium ompA gene is 597 bp,encoding 199 amino acids.Using ... |
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| Keywords: | Bordetella avium OmpA secondary structure B-cell epitope prediction |
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