| 三色堇花色素合成途径中部分结构基因的克隆及生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 龚 胜,孙海燕,张 珂,等.三色堇花色素合成途径中部分结构基因的克隆及生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2015,43(7):133-142. |
| |
| 作者姓名： | 龚 胜 孙海燕 张 珂 等 |
| |
| 作者单位： | 海南大学 园艺园林学院，热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室,海南大学 园艺园林学院，热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室,海南大学 园艺园林学院，热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31060265，31260488）；海南大学中西部计划学科建设项目（ZXBJH-XK008） |
| |
| 摘 要： | 【目的】对三色堇花色素合成的3个结构基因VwCHS、VwCHI和VwF3 H进行克隆以及生物信息学分析。【方法】利用RACE/PCR技术克隆得到VwCHS、VwCHI和VwF3 H基因的全长序列,并通过在线分析软件对其生物信息学进行分析。【结果】获得VwCHS、VwCHI和VwF3 H的cDNA全长分别是1 481,975和1 361bp;经多重序列比对发现这3个基因编码的氨基酸与其他植物相关氨基酸一致性较高,主要集中在62%~90%,并且在CHS氨基酸序列中有4个催化活性位点(Cys171、Phe222、His310、Asn343),在CHI氨基酸序列中有4个催化活性位点(Thr50、Tyr108、Asn115、Ser192),在VwF3H氨基酸序列中有5个催化活性位点(Asp218、His253、Arg215、Arg284、Ser286);VwCHS、VwCHI、VwF3H的蛋白质分子量分别为9.91,5.37,4.1ku,等电点为5.02,5.16,5.44;二级结构预测发现,VwCHS和VwCHI二级结构主要是α螺旋,分别占43.39%和41.89%,VwF3H的蛋白质二级结构主要是无规则卷曲,占42.30%;聚类分析发现VwCHS、VwCHI和VwF3H分别归属于各自的聚类簇。【结论】VwCHS、VwCHI和VwF3H是不存在信号肽的非跨膜蛋白。
|
| 关 键 词： | 三色堇 查尔酮合成酶（CHS） 查尔酮异构酶（CHI） 黄烷酮-3-羟化酶（F3H） 生物信息学 基因克隆 |
| 收稿时间： | 2014/12/5 0:00:00 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《西北农林科技大学学报(社会科学版)》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西北农林科技大学学报(社会科学版)》下载免费的PDF全文 |
|
