| 山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王梦雅,赵学亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡红莲,高民.山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2018(21). |
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| 作者姓名： | 王梦雅 赵学亮 徐明 李洋 宋利文 高峰 胡红莲 高民 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学动物科学学院;内蒙古农牧业科学院动物营养与饲料研究所;内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室 |
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| 摘 要： | 为了研究山羊紧密连接相关蛋白ZO-1基因编码蛋白的组成结构及生物学特性,试验应用生物信息学方法对ZO-1蛋白的氨基酸序列组成、理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、蛋白质二级和三级结构进行预测与分析,并构建系统进化树。结果表明:该基因全长1 164 bp,编码387个氨基酸; ZO-1蛋白分子质量为45. 25 ku,理论等电点为6. 52,由20种氨基酸组成,呈酸性,不稳定指数为58. 54,是一个不稳定的亲水性蛋白;具有41个潜在的磷酸化位点,不存在信号肽和跨膜区;亚细胞定位分析显示,ZO-1蛋白主要存在于细胞核,在线粒体和细胞质中也有少量分布;二级结构预测显示,ZO-1蛋白以α-螺旋为主要结构,比例为68. 73%;三级结构预测显示,ZO-1蛋白是由α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规卷曲组合成的超二级结构,经折叠、弯曲等一系列复杂过程形成了一个稳定的结构;系统进化树分析发现,山羊的ZO-1基因编码蛋白序列首先与绵羊聚为一类,然后与牛聚为一类,这与动物学分类结果一致,这种同源性在一定程度上代表着物种亲缘关系的远近。说明ZO-1基因有望成为维持山羊瘤胃上皮组织屏障功能和预防亚急性瘤胃酸中毒疾病的重要基因。
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