阿拉善双峰驼MSTN基因序列生物信息学分析 |
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引用本文: | 杨惠,额尔敦木图,姜建强,刘图雅,戴钦,阿拉腾呼依嘎,白龙.阿拉善双峰驼MSTN基因序列生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2018(1). |
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作者姓名: | 杨惠 额尔敦木图 姜建强 刘图雅 戴钦 阿拉腾呼依嘎 白龙 |
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作者单位: | 内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室;内蒙古阿拉善左旗农牧业局兽医局;内蒙古阿拉善经济开发区农牧业服务中心;内蒙古阿拉善左旗巴润别立动物卫生监督站;内蒙古鄂托克旗蒙西镇农牧业执法队; |
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摘 要: | 为了研究阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN)基因,进一步探讨阿拉善双峰驼MSTN基因的结构及功能,试验采用5对引物对阿拉善双峰驼MSTN基因进行PCR扩增,所得产物进行序列拼接,利用生物信息学方法对阿拉善双峰驼MSTN基因的结构、理化性质及其编码蛋白信号肽、跨膜位置、亚细胞定位等进行分析,并讨论了阿拉善双峰驼与其他物种MSTN氨基酸序列的进化关系。结果表明:阿拉善双峰驼MSTN基因长7.3 kb,1~581 bp为第一外显子区,2 384~2 757 bp为第二外显子区,4 800~6 737 bp为第三外显子区。阿拉善双峰驼MSTN蛋白属于疏水性不稳定蛋白,18~19位氨基酸是最有可能的剪切位点,作为信号肽的可能性很大;二级结构中α-螺旋占22.40%,延伸链占26.67%,β-转角占7.73%,无规则卷曲占43.20%;阿拉善双峰驼MSTN蛋白有1个跨膜结构区域,其功能域可能位于278~375位氨基酸处。阿拉善双峰驼MSTN基因与哺乳类及灵长类动物的亲缘关系较近,与猪的亲缘关系最近(相似性高达99.2%)。说明阿拉善双峰驼MSTN基因编码的蛋白符合一般TGF-β超家族的结构特征,并符合已知MSTN蛋白的结构特征,与猪、灵长类及反刍类动物的分子进化距离较近。
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