猪流行性腹泻病毒ORF3基因云南株的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 刘丽娟,马光强,杨丽彥,张双翔,胡兴义,周碧君,王开功,文明,程振涛.猪流行性腹泻病毒ORF3基因云南株的克隆及序列分析[J].黑龙江畜牧兽医,2018(3). |
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作者姓名: | 刘丽娟 马光强 杨丽彥 张双翔 胡兴义 周碧君 王开功 文明 程振涛 |
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作者单位: | 贵州大学动物科学学院;贵州省动物疫病研究室;黔南民族职业技术学院;贵州轻工职业技术学院;贵州省动物疫病预防控制中心; |
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摘 要: | 为了解云南省与贵州省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)ORF3基因变异情况,试验采用PCR技术、分子克隆及序列分析方法对云南省昆明市某规模化养猪场发生腹泻的6头病猪的粪便病料样本进行了研究。结果表明:1株PEDV ORF3基因均含有964个碱基,编码320个氨基酸;ORF3基因均无碱基缺失或插入,存在部分碱基变异;与GenBank中登录的部分PEDV核苷酸序列的同源性为95.1%~99.9%,推导氨基酸序列的同源性为94.2%~98.7%;与经典毒株CV777及贵州毒株GZZY、GZMR、GZZAI1亲缘关系较近,与贵州(GZTW3、GZRRH)毒株亲缘关系较远。说明云南省与贵州省主要流行的毒株同源性较高且存在一定相关性。
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