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地黄纤维素合酶基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:周延清,张喻,李静云,陈娟娟,王婉珅,苑璐璐,魏俊.地黄纤维素合酶基因的克隆与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2015(1):21-24.
作者姓名:周延清  张喻  李静云  陈娟娟  王婉珅  苑璐璐  魏俊
作者单位:河南师范大学生命科学学院;资源微生物与功能分子河南省高校重点实验室培养基地/河南师范大学;河南省周口市科学技术局
基金项目:河南省基础与前沿技术研究计划(编号:092300410009);河南省教育厅科学技术研究重点项目(编号:14B180028);国家大学生创新创业训练计划(编号:201310476102);河南省高校科技创新团队支持计划(编号:13IRTSTHN009)
摘    要:根据以前克隆的地黄Rgh BNG基因碱基序列,利用Primer Premier 5.0设计特异引物,采用hi TAIL-PCR技术从怀地黄基因组DNA中扩增出578 bp DNA片段。经生物信息学分析发现,它与根癌土壤杆菌、土壤杆菌的纤维素合酶基因的同源性达81%~91%;它所含的453 bp的开放阅读框(ORF)编码蛋白质的氨基酸序列与根癌土壤杆菌、土壤杆菌、菜豆根瘤菌、豌豆根瘤菌纤维素合酶基因编码蛋白质氨基酸序列的同源性高达83%~99%,说明蛋白质可能具有纤维素合酶的结构域。用hi TAIL-PCR技术克隆怀地黄纤维素合酶基因,为进一步研究其分子作用机制和在地黄分子育种中的应用奠定了基础。

关 键 词:怀地黄  纤维素合酶  hi  TAIL-PCR技术  生物信息学分析
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