| 细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘田莉,孟庆玲,乔军,陈诚,马玉,胡政香,才学鹏,陈创夫.细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析[J].华北农学报,2015(2). |
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| 作者姓名： | 刘田莉 孟庆玲 乔军 陈诚 马玉 胡政香 才学鹏 陈创夫 |
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| 作者单位： | 1. 石河子大学 动物科技学院,新疆 石河子,832003
2. 中国农业科学院 兰州兽医研究所,甘肃 兰州,730046 |
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| 基金项目： | 国家公益性(农业)行业专项(201303037)；国家国际科技合作项目(2014DFR31310)；新疆自治区研究生科研创新项目 |
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| 摘 要： | 为了研究绵羊细粒棘球蚴重要抗原基因Tetraspanin 1-TSP1(TSP1)和Tetraspanin 1-TSP6(TSP6)的功能,对Gen Bank中Eg基因组数据库检索,获得TSP1和TSP6的c DNA序列并设计特异性引物。以Eg头节为总RNA模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到p MD19-T载体后测序并进行生物信息学分析。TSP1 c DNA全长792个核苷酸,编码263个氨基酸,该多肽含有3个潜在的N端糖基化位点,2个N端酰基化位点,与已登录的标准株TSP1基因序列(EG_11043)同源性为98.99%,其推导的氨基酸序列同源性为98.48%;TSP6 c DNA全长666个核苷酸,编码221个氨基酸,该多肽含有5个N端酰基化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,与已登录的标准株TSP6基因序列(EG_00715)同源性为98.18%,其推导的氨基酸序列同源性为85.07%。运用分子生物学软件对Eg TSP1和TSP6基因进行生物信息学分析,预测已知序列的蛋白质抗原的结构和表位,为疫苗的研发奠定了前期基础。
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| 关 键 词： | 细粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of TSP1 and TSP6 Gene of Echinococcus granulosus |
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| LIU Tian-li,MENG Qing-ling,QIAO Jun,CHEN Cheng,MA Yu,HU Zheng-xiang,CAI Xue-peng,CHEN Chuang-fu.Cloning and Bioinformatics Analysis of TSP1 and TSP6 Gene of Echinococcus granulosus[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2015(2). |
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| Authors: | LIU Tian-li MENG Qing-ling QIAO Jun CHEN Cheng MA Yu HU Zheng-xiang CAI Xue-peng CHEN Chuang-fu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cystic echinococcosis Antigen gene Gene cloning Bioinformatics analysis |
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