| 猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 祝俊鹏,杨彬,兰喜,柳纪省,马小军.猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析[J].华北农学报,2015(2). |
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| 作者姓名： | 祝俊鹏 杨彬 兰喜 柳纪省 马小军 |
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| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学 动物医学院,甘肃 兰州,730070
2. 中国农业科学院 兰州兽医研究所，家畜疫病病原生物学国家重点实验室，草食动物疫病重点开放实验室，甘肃 兰州 730046 |
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| 摘 要： | 为了深入研究嵴病毒(sw Ko V)主要结构蛋白基因VP1,根据Gen Bank中已发表的猪嵴病基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增猪嵴病毒CH441株VP1基因,并对其进行克隆与测序分析。结果表明,sw Ko V CH441株的VP1基因为762 bp,与Gen Bank已发表的嵴病毒属的15株嵴病毒序列的VP1基因相比较,sw Ko V CH441株的VP1基因与其他各毒株VP1基因的核苷酸同源性为81.5%~90.2%,氨基酸同源性为86.6%~96.9%,进化分析显示,sw Ko V CH441株与GS-1株之间的亲缘关系较近。生物信息学分析显示,VP1蛋白理论等电点(p I)为4.40,理论分子质量为26.978 2 k Da;其序列上共发现18个磷酸化位点,分别为Ser(7)、Thr(6)和Tyr(5),而蛋白的磷酸化与信号转导有关,预测该蛋白为一重要的信号转导分子;无信号肽和跨膜区。为进一步开展sw Ko V CH441株VP1基因在遗传变异等方面的研究奠定了理论基础。
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| 关 键 词： | VP1 基因 克隆 DNA测序 序列分析 |
Molecular Cloning and Sequence Analysis of the VP1 Gene of Porcine kobuvirus |
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| ZHU Jun-peng,YANG Bin,LAN Xi,LIU Ji-xing,MA Xiao-jun.Molecular Cloning and Sequence Analysis of the VP1 Gene of Porcine kobuvirus[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2015(2). |
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| Authors: | ZHU Jun-peng YANG Bin LAN Xi LIU Ji-xing MA Xiao-jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | VP1 gene Cloning DNA sequencing Sequence analysis |
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