| 荔枝古树胚性愈伤组织Fe-SOD成员基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 练从龙,赖钟雄,卢秉国,林玉玲,冯新.荔枝古树胚性愈伤组织Fe-SOD成员基因克隆及生物信息学分析[J].热带作物学报,2014,35(1):74-81. |
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| 作者姓名： | 练从龙 赖钟雄 卢秉国 林玉玲 冯新 |
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| 作者单位： | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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| 基金项目： | 福建省农业科技平台（No. 2008N2001）；国家科技支持计划项目（No. 2007BAD07B01）。 |
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| 摘 要： | 为了解Fe-SOD在荔枝古树胚性愈伤组织保存中的分子机制,选择荔枝古树"宋荔"花药诱导而来的胚性愈伤组织为试验材料,采用同源克隆和RACE方法,获得荔枝Fe-SOD的两个转录本和基因组序列,并对该基因组的内含子进行分析。克隆获得长1 285 bp含有完整开放阅读框的荔枝Fe-SOD核酸序列,其编码1个含有250个氨基酸的蛋白质,将该序列命名为LcFe-SOD7a。生物信息学分析结果表明:该蛋白为稳定的、亲水的、含跨膜结构域的偏酸性蛋白质,定位于微体(过氧化物酶体)和细胞质,具有多样的磷酸化位点。LcFe-SOD7a基因组序列长2 284 bp,含7个内含子,其中第4个内含子较长,达920 bp。同时还得到其中的1条内含子驻留型可变剪接基因,该可变剪接基因提前终止,仅编码207个氨基酸的蛋白质,将该可变剪接基因命名为LcFe-SOD7b。
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| 关 键 词： | 荔枝古树 胚性愈伤组织 Fe-SOD 克隆 可变剪接 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Fe-SOD Gene from Embryogenic Callus of an Ancient Litchi Tree |
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| LIAN Conglong,LAI Zhongxiong,LU Bingguo,LIN Yuling and FENG Xin.Cloning and Bioinformatics Analysis of Fe-SOD Gene from Embryogenic Callus of an Ancient Litchi Tree[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(1):74-81. |
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| Authors: | LIAN Conglong LAI Zhongxiong LU Bingguo LIN Yuling and FENG Xin |
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| Institution: | Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | An ancient litchi tree Embryogenic callus Fe-SOD Cloning Alternative splicing Bioinformatics |
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