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口蹄疫病毒O、A和AsiaⅠ型分型基因芯片的构建与评价
引用本文:刘志鹏,欧阳达,黄小波,滑翔,赵玉佳,曹三杰,文翼平,伍锐,赵勤,文心田.口蹄疫病毒O、A和AsiaⅠ型分型基因芯片的构建与评价[J].农业生物技术学报,2018(2).
作者姓名:刘志鹏  欧阳达  黄小波  滑翔  赵玉佳  曹三杰  文翼平  伍锐  赵勤  文心田
作者单位:四川农业大学动物医学院猪病研究中心;农业部兽用药物与兽医诊断技术四川科学观测实验站;四川农业大学国家级动物类实验教学示范中心;
摘    要:口蹄疫(Foot-and-mouth disease,FMD)是由口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)引起的一种高度接触传染性动物疫病。本研究拟建立一种能区分FMDV O/A/AsiaⅠ型的基因芯片。根据FMDV O/A/AsiaⅠ型的VP1基因序列设计3对特异性引物,用RT-PCR扩增获得248、206和239 bp的三个靶基因片段,并针对这三个片段分别设计了3种探针,以引物荧光标记法标记靶基因,建立了一种鉴别FMDV O/A/AsiaⅠ型的分型基因芯片并进行了敏感性、特异性、重复性和保存期评价。结果表明最佳反应条件为:水化温度37℃,封闭液为0.25%BH_4Na/25%乙醇,杂交温度为42℃。灵敏性实验表明,FMDV-O检测限为118 pg/mL,FMDV-A为18.4 pg/mL,FMDV-AsiaⅠ为129 pg/mL,芯片方法灵敏度比常规RT-PCR高10~100倍;特异性实验表明,O、A和AsiaⅠ三型之间无交叉杂交;该芯片可至少保存3个月仍能重复使用。本研究建立的FMDV分型基因芯片为O、A和AsiaⅠ型鉴别提供了新方法。

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