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7个苹果KNOX转录因子基因克隆、表达和蛋白互作分析
引用本文:卢苗,李佩,荣钰莹,张梦涵,贾鹏,栾好安,齐国辉,张雪梅,董庆龙.7个苹果KNOX转录因子基因克隆、表达和蛋白互作分析[J].果树学报,2023(5):841-851.
作者姓名:卢苗  李佩  荣钰莹  张梦涵  贾鹏  栾好安  齐国辉  张雪梅  董庆龙
作者单位:河北农业大学林学院
摘    要:【目的】KNOTTED1 like homeobox(KNOX)蛋白在植物生长发育等多个生物学过程中发挥着重要作用。以紫弘富士为材料,分离了多个苹果(Malus domestica)KONX基因,研究其结构域、进化分析、组织表达、非生物胁迫响应及其与MdOFP相互作用情况。【方法】使用RT-PCR技术克隆获得7个MdKNOX基因并进行生物信息学分析。利用Array技术检测MdKNOX基因在苹果不同组织中的表达模式。使用RT-qPCR技术检测MdKNOX基因在盐胁迫和渗透胁迫下的表达模式。通过Y2H实验检测了MdKNOX蛋白与MdOFP蛋白的互作情况。【结果】测序结果表明,获得了7个KNOX转录因子cDNA:MdKNOX1、MdKNOX2、MdKNOX5、MdKNOX10、MdKNOX13、MdKNOX16和MdKNOX22(GenBank登录号:MG021644~MG021650)。结构域分析表明,获得的7个MdKNOX蛋白序列均含有MEINOX、HD和ELK结构域。进化分析表明,MdKNOX1、MdKNOX2和MdKNOX5属于KNOXⅡ亚组;MdKNOX10、MdKNOX13、Md...

关 键 词:苹果  KNOX转录因子  基因克隆  表达分析  蛋白互作
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