| 葡萄CHS基因家族鉴定与表达分析 |
| |
| 引用本文： | 成永娟,张明月,曹雪璟,毛娟,陈佰鸿.葡萄CHS基因家族鉴定与表达分析[J].果树学报,2023(5):861-874. |
| |
| 作者姓名： | 成永娟 张明月 曹雪璟 毛娟 陈佰鸿 |
| |
| 作者单位： | 甘肃农业大学园艺学院 |
| |
| 基金项目： | 甘肃农业大学国家级大学生创新创业训练计划（202010733039）； |
| |
| 摘 要： | 【目的】明确葡萄查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)基因家族响应外源激素和非生物胁迫的表达模式。【方法】利用生物信息学方法对葡萄CHS基因家族成员进行理化性质、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)检测VvCHS基因在外源激素和非生物胁迫下的表达情况，将筛选出的VvCHS3基因构建植物表达载体并进行烟草瞬时转化以确定其表达位置。【结果】在葡萄基因组中共鉴定出7个VvCHS基因成员，分布于5条不同的染色体上，蛋白质二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。系统进化和基因对选择压表明，CHS基因家族基因可分为三大亚族，葡萄CHS基因家族与其他物种之间主要进行纯化选择。共线性分析表明，VvCHS3与VvCHS4、VvCHS3与VvCHS5、VvCHS4与VvCHS5之间存在共线性关系。顺式作用元件预测结果表明，大部分VvCHS基因成员可能同时对多种逆境胁迫有响应。qRT-PCR分析发现，VvCHS基因具有明显的组织特异性，在根中表达水平最高，茎中表达水平最低。在5 mmol·L
|
| 关 键 词： | 葡萄 查尔酮合酶 生物信息学 qRT-PCR 基因克隆 |
|
|
