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欧李NAC基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:张忠鑫,郭夕雯,汪泽文,王鹏飞,张建成,杜俊杰,穆霄鹏.欧李NAC基因家族的鉴定及表达分析[J].果树学报,2023(2):206-222.
作者姓名:张忠鑫  郭夕雯  汪泽文  王鹏飞  张建成  杜俊杰  穆霄鹏
作者单位:山西农业大学园艺学院
基金项目:中国博士后科学基金面上项目(2017M621106);
摘    要:【目的】对ChNAC基因进行鉴定并分析其表达模式,明晰ChNAC基因结构,预测其潜在功能,筛选抗逆相关基因,为欧李抗逆性状形成的分子机制研究提供理论依据。【方法】在全基因组数据的基础上对ChNAC基因进行生物信息学分析,并对不同非生物胁迫处理下ChNAC基因的转录组数据进行分析。【结果】欧李NAC基因家族有76个家族成员,33个ChNAC基因编码碱性氨基酸,17个ChNAC基因编码酸性氨基酸,26个ChNAC基因编码中性氨基酸。ChNAC蛋白均为亲水性蛋白,80%ChNAC蛋白为不稳定蛋白,79%ChNAC蛋白定位于细胞核中。ChNAC基因可分为17个亚族,主要为OsNAC7、ANAC001、ONAC003等亚族。ChNAC基因多存在于Chr5染色体上,有8对ChNAC基因由染色体大片段复制而来,其中ChNAC01、ChNAC20、ChNAC64这3条基因是互为共线性。启动子分析结果表明ChNAC基因可能参与欧李的生长发育、激素调控及胁迫响应等方面。【结论】ChNAC基因的表达具有组织特异性。ChNAC基因家族成员响应不同的胁迫处理,尤其是ChNAC49基因在盐胁迫、干旱胁迫、低温胁迫...

关 键 词:欧李  ChNAC基因家族  生物信息学分析  表达模式
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