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苹果花脸症状相关基因差异表达的分析
引用本文:郑朋飞,张学勇,孙骞,王楚堃,杨钰莹,芮麟,宋来庆,张振鲁,由春香.苹果花脸症状相关基因差异表达的分析[J].果树学报,2023(6):1109-1120.
作者姓名:郑朋飞  张学勇  孙骞  王楚堃  杨钰莹  芮麟  宋来庆  张振鲁  由春香
作者单位:1. 山东农业大学园艺科学与工程学院·作物生物学国家重点实验室;2. 烟台市农业科学研究院;3. 广饶县林业发展服务中心
摘    要:【目的】苹果花脸病主要由苹果锈果类病毒(apple scar skin viroid,ASSVd)引起,是一种严重危害苹果产量和果实品质的病害,通过分析苹果花脸症状相关基因表达,探索花脸症状形成的潜在机制。【方法】削取无症状且无ASSVd侵染的果皮和表现花脸症状的弘前富士苹果果皮,提取果皮总RNA,通过高通量测序并进行转录组数据分析。【结果】利用RT-PCR方法从表现花脸症状的苹果果皮中得到两条ASSVd序列,其基因组长度分别为331 nt和330 nt,与已公布的ASSVd山东烟台苹果分离物SDYT-1(MW302328.1)和SDYT-3(MW315909.1)完全一致。转录组测序结果表明,与无症状果皮相比,表现花脸症状的果皮中共有差异表达基因6938个,其中有3331个基因显著上调,3607个基因显著下调。通过差异表达基因功能注释分析,表明这些差异基因参与到植物激素(茉莉酸、水杨酸和生长素)合成和信号转导、苯丙烷生物合成等代谢途径。此外,转录组数据分析发现与植物防御反应相关转录因子的编码基因,如MdWRKY18-like、MdWRKY71、MdNAC29、MdWRKY70等在表现...

关 键 词:苹果  ASSVd  转录组分析  差异表达基因  转录因子
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