| 基于SLAF-seq技术的不同类型越橘遗传变异和群体结构研究 |
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| 引用本文： | 刘有春,李嘉琦,魏鑫,杨艳敏,张舵,王兴东,孙斌,杨玉春,王升,高树清,王宏光,徐艺格,袁兴福,刘成.基于SLAF-seq技术的不同类型越橘遗传变异和群体结构研究[J].果树学报,2023(8):1534-1545. |
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| 作者姓名： | 刘有春 李嘉琦 魏鑫 杨艳敏 张舵 王兴东 孙斌 杨玉春 王升 高树清 王宏光 徐艺格 袁兴福 刘成 |
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| 作者单位： | 1. 辽宁省果树科学研究所;2. 辽宁省农业科学院 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系专项（CARS-29-yc-10）； |
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| 摘 要： | 【目的】利用越橘属栽培品种及野生资源在全基因组范围内筛选差异SNP分子标记，分析其遗传变异，了解不同类型群体间的遗传变异、基因交流、群体结构，为越橘种质创新提供遗传背景依据。【方法】以越橘属9个种的62份种质资源为材料，利用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)获得的基因组SNP标记比对到品种Draper参考基因组上，进行供试材料遗传研究。【结果】测序获得169.87 Mb reads数据，平均Q30值94.99%，包含172 513个多态性SLAF标签，筛选到高质量SNP标记4 133 595个，均匀分布在越橘12条染色体上。基于SNP标记的系统进化树准确反映了供试野生、北高丛和南高丛类群遗传差异以及品种间系谱遗传关系，反映出野生类型与栽培品种遗传差异显著，供试野生种具有独立的遗传背景且种间无基因交流发生，但野生种到栽培种存在单向的基因流；栽培品种类群存在明显的亚群结构，亚群间存在普遍的基因交流；半高丛品种北陆和南高丛品种军号与北高丛类型紧密聚类，矮丛品种美登、半高丛品种北村、黑珍珠遗传背景倾向于野生种。【结论】栽培品种近亲杂交和骨干亲本高频率使用导致品...
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| 关 键 词： | 越橘 SLAF-seq技术 SNP 遗传群体结构 |
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