| 基于全基因组预测和分析花生果腐病原菌分泌蛋白 |
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| 引用本文： | 王辉灵,韩会玲,王晓晗,焦镇,李步阳,何弯弯,孙伟明.基于全基因组预测和分析花生果腐病原菌分泌蛋白[J].四川农业大学学报,2024(1):11-18+38. |
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| 作者姓名： | 王辉灵 韩会玲 王晓晗 焦镇 李步阳 何弯弯 孙伟明 |
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| 作者单位： | 1. 河北科技师范学院海洋资源与环境学院/农学与生物科技学院/河北省作物逆境生物学重点实验室(筹) |
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| 基金项目： | 河北省重点研发计划项目（花生现代种业科技创新团队21326316D-6）；;河北省现代农业产业技术体系油料创新团队（HBCT2023030206）；;河北省自然科学基金青年科学基金项目（C2021407021）； |
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| 摘 要： | 【目的】为分析花生果腐病病原菌-新孢镰刀菌的侵染机制并筛选可用基因。【方法】以全基因组测序结果为基础，根据分泌蛋白与效应因子的特点，采用SignalP、TMHMM、WoLF PSORT及NetGPI等软件一步步筛选，对新孢镰刀菌全基因组12 756条蛋白序列进行了分泌蛋白预测和功能分析。【结果】新孢镰刀菌全基因组编码蛋白中有701条序列具有典型的分泌蛋白特征，占蛋白总数的5.49%，其长度主要分布在101～700个氨基酸范围内。信号肽的分析结果表明，信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守，其切割位点属于典型的A-X-A型。对分泌蛋白功能预测结果表明，656个分泌蛋白获得了功能注释，其功能主要涉及碳水化合物的运输、代谢过程，蛋白翻译后修饰和氨基酸代谢、运输过程。分泌蛋白中效应蛋白预测结果表明，新孢镰刀菌分泌蛋白中共有161个潜在的效应蛋白。【结论】对新孢镰刀菌分泌蛋白的有效预测和功能分析，为筛选新效应蛋白，明确其致病机理，筛选寄主抗性基因奠定了基础。同时为花生果腐病抗性品种选育和综合防治提供理论依据。
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| 关 键 词： | 花生果腐病 新孢镰刀菌 生物信息学 分泌蛋白 |
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