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鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析
引用本文:鲁伟,吴允,徐璐,徐琪,常国斌,陈国宏.鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析[J].浙江农业学报,2016,28(12):2028.
作者姓名:鲁伟  吴允  徐璐  徐琪  常国斌  陈国宏
作者单位:扬州大学 动物科学与技术学院,江苏 扬州 225009
基金项目:江苏省六大人才高峰项目资助 (2015-NY-019); 江苏省农业科技支撑(BE2013392)
摘    要:为了研究鸡TGF-β2基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用PCR-SSCP方法对16个鸡种的TGF-β2启动子区的554~824 bp(即3号染色体的19 433 476~19 433 746 bp)进行基因分型,经测序,共检测到3个有效的SNPs位点,分别是679位点的C/G,699位点的G/A,774位点的T/C。其中大骨鸡和太湖鸡在3个位点均检测到SNP存在,AA鸡在3个位点都没有发现SNPs。分别利用生物信息学软件JASPAR和MethPrimer预测TGF-β2基因启动子区转录因子结合位点和CpG岛,发现SNP位点可改变转录因子结合位点且位于CpG岛上,表明TGF-β2启动子区SNPs可能通过不同方式影响基因表达调控。

关 键 词:    TGF-β2    启动子    SNP  
收稿时间:2016-05-12

Polymorphism analysis of TGF-β2 gene promoter of chickens
LU Wei,WU Yun,XU Lu,XU Qi,CHANG Guo-bin,CHEN Guo-hong.Polymorphism analysis of TGF-β2 gene promoter of chickens[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2016,28(12):2028.
Authors:LU Wei  WU Yun  XU Lu  XU Qi  CHANG Guo-bin  CHEN Guo-hong
Institution:College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China
Abstract:
Keywords:chicken  TGF-β2  promoter  SNP  
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