| 鸡circ＿DNAJC3的鉴定及功能预测 |
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| 引用本文： | 李欢,安凯,孙长花,孙红艳.鸡circ＿DNAJC3的鉴定及功能预测[J].四川农业大学学报,2024(1):126-133. |
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| 作者姓名： | 李欢 安凯 孙长花 孙红艳 |
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| 作者单位： | 1. 扬州市职业大学生物与化工工程学院;2. 扬州市农产品智能测控与清洁生产工程技术研究中心;3. 江阴市富仁高科股份有限公司南京分公司;4. 扬州大学动物科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 江苏省高校“青蓝工程”资助项目； |
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| 摘 要： | 【目的】鉴定鸡circ＿DNAJC3并预测其功能，为进一步研究其在细胞生物学过程中的作用奠定基础。【方法】通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳、Sanger测序、亚细胞定位、RT-qPCR和生物信息学软件鉴定鸡circ＿DNAJC3的环状结构及其稳定性、解析其在细胞中的位置和在不同组织中的表达水平、并预测其功能和可能的作用方式。【结果】鸡circ＿DNAJC3由外显子2至4构成稳定的共价环状结构，共311 bp；具有物种保守性；在细胞质中显著性富集（P<0.05）；在回肠、胸腺、脾脏、盲肠中高表达（P<0.05）而在下丘脑和小脑中低表达（P<0.05）；其可能互作的RNA结合蛋白为AGO2、CELF2、PTBP1和HNRNPC；可能与gga-miR-132b-5p发生互作，其靶基因可能通过钙离子信号通路参与细胞增殖、分化、凋亡及代谢。【结论】揭示了鸡circ＿DNAJC3真实存在，可能与RNA结合蛋白和gga-miR-132b-5p互作参与调节细胞生物学过程。
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| 关 键 词： | circ＿DNAJC3 巨噬细胞HD11 环状RNA circRNA-miRNA-mRNA |
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