| 玉米SNAC转录因子的基因结构特征与逆境调控预测 |
| |
| 引用本文： | 罗平,庞博,崔进鑫,于爽,王晓楠,程名,陈勇,高文伟,郝转芳.玉米SNAC转录因子的基因结构特征与逆境调控预测[J].中国农业科技导报,2021,23(10):35-44. |
| |
| 作者姓名： | 罗平 庞博 崔进鑫 于爽 王晓楠 程名 陈勇 高文伟 郝转芳 |
| |
| 作者单位： | 1.新疆农业大学农学院， 乌鲁木齐 830000；
2.中国农业科学院作物科学研究所， 北京 100081 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金国际合作项目(31661143010);
国家重点研发计划项目（2016YFD0101803） |
| |
| 摘 要： | NAC蛋白是植物特有的转录因子，在植物发育和各种非生物逆境应答中发挥着重要作用。为更好地揭示玉米SNAC(stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)家族的耐逆境胁迫功能，对其基因的结构特征及可能的调控机理进行了预测。利用生物信息学方法，鉴定了玉米16个SNAC家族基因，并对该基因家族各编码蛋白的理化性质、基因结构、潜在的磷酸化位点、蛋白质二级结构、基因进化关系、基因组序列结构和启动子结合元件等信息进行分析。分析结果表明：玉米16个SNACs不具有跨膜结构，且均具有N-末端保守结构域和高度可变的C-末端结构域。系统发育分析表明，同一亚群中密切相关的成员具有相似的基因结构，推测在不同植物中会具有类似的耐逆功能。磷酸化位点分析表明，玉米SNAC家族存在着大量的磷酸化位点。二级结构预测表明，玉米SNAC的转录调控区具有高度的内在灵活性。启动子分析表明，玉米SNAC家族基因启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件。这些结果为玉米耐逆境研究提供了候选基因，对促进玉米SNAC家族功能分析的进展具有重要意义。
|
| 关 键 词： | 玉米（Zea Mays L.） SNAC基因家族 基因结构特征 逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2020-07-27 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国农业科技导报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国农业科技导报》下载免费的PDF全文 |
|
