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甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析
引用本文:彭焕,彭德良,黄文坤.甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析[J].农业生物技术学报,2009,17(6).
作者姓名:彭焕  彭德良  黄文坤
作者单位:彭焕(中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京,100193;中国农业科学院研究生院,北京,100081);彭德良,黄文坤(中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京,100193) 
基金项目:国家重大基础研究发展规划(973)项目,国家自然科学基金,国家科技支撑计划,公益性行业科研专项,北京市农委政府购买科技服务项目 
摘    要:β-1,4内切葡聚糖酶是植物寄生线虫食道腺分泌的一类细胞壁降解酶,在植物线虫的侵染过程中具有重要的作用.以马铃薯腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)为材料,用RT-PCR和RACE方法,获得了β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA全长,并将该基因命名为Dd-eng-1b(GenBank登录号为FJ430142).此cDNA全长序列为1 640 bp,包括1个1 443 bp的完整ORF,编码1含481个氨基酸的蛋白,其理论分子量为50.89 kD,等电点pI为6.94.序列比对分析表明,含有糖基水解酶的保守结构域,属于纤维素酶第五家族成员,N端具有19个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBD Ⅱ).cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含4个内含子,长度分别为36、76、187和344bp,切割点符合5'-GT……AG-3'的规律.系统进化树分析表明,该基因与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测该基因可能来源于细菌的水平基因转移.

关 键 词:马铃薯腐烂茎线虫  β-1  4-内切葡聚糖酶  GHF5家族  Ditylenchus  destructor  β-1  4-endoglucanase
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