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玉米miR395基因家族生物信息学分析及靶基因预测
引用本文:王丽,路运才.玉米miR395基因家族生物信息学分析及靶基因预测[J].中国农学通报,2022,38(14):30-37.
作者姓名:王丽  路运才
作者单位:1.黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨 150080;2.黑龙江省肇东市农业技术推广中心,黑龙江肇东 151100
基金项目:国家十三五重点研发计划“玉米分子设计育种”(2016YFD0101803);;黑龙江省自然科学基金联合引导项目“利用连锁和关联分析发掘玉米抗低温出苗优异等位基因”(LH2019C056);
摘    要:MicroRNA(miRNA)具有调控基因表达的作用,为了揭示玉米miR395基因家族进化规律、表达模式及功能,开展了基因定位、多序列比对、顺式作用元件分析、二级结构分析、靶基因预测及表达模式分析。结果共鉴定到16个成员,且均集中分布在第2号、第10号染色体上;19个碱基完全相同,表明在进化过程中具有高度保守性;具有18个ABRE类顺式作用元件,推测其通过参与调节ABA信号传导,提高玉米抗逆性;多数靶向基因参与硫酸盐同化,初步推测玉米miR395基因家族参与玉米硫代谢;转录组分析发现zma-miR395基因家族中一些成员为下调表达模式。研究结果为后续玉米相关基因的功能解析奠定了基础。

关 键 词:玉米  miR395基因家族  生物信息学分析  靶基因  表达模式  
收稿时间:2021-03-20

miR395 Gene Family in Maize: Bioinformatics Analysis and Target Gene Prediction
WANG Li,LU Yuncai.miR395 Gene Family in Maize: Bioinformatics Analysis and Target Gene Prediction[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2022,38(14):30-37.
Authors:WANG Li  LU Yuncai
Institution:1.College of Advanced Agriculture and Ecological Environment, Heilongjiang University, Harbin 150080;2.Heilongjiang Zhaodong Agricultural Technology Extension Center, Zhaodong, Heilongjiang 151100
Abstract:
Keywords:maize  miR395 gene family  bioinformatics analysis  target gene  expression pattern  
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