| 甜菜TIFY基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 巩永永,端木慧子.甜菜TIFY基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析[J].中国农学通报,2022,38(8):17-24. |
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| 作者姓名： | 巩永永 端木慧子 |
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| 作者单位： | 1.黑龙江大学 农业微生物技术教育部工程研究中心,哈尔滨 150500;2.黑龙江大学生命科学学院 黑龙江省寒地生态修复与资源利用重点实验室,哈尔滨 150080;3.黑龙江大学生命科学学院 黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室,哈尔滨 150080 |
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| 基金项目： | 国家自然基金青年项目“甜菜M14品系BvM14-RIN4蛋白盐胁迫响应蛋白互作网络的研究”(31801426)； |
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| 摘 要： | TIFY转录因子对植物体生长发育和胁迫响应有重要调控作用,本研究目的在于鉴定分析甜菜(Beta vulgaris L.)中的TIFY转录因子。试验以甜菜基因组数据为基础,利用生物信息学技术在全基因组水平鉴定并分析甜菜TIFY家族成员。结果表明：甜菜中共有21条TIFY基因,基因间序列相似性较低;共线性分析发现只有BvTIFY15与BvTIFY18之间存在基因复制事件;BvTIFY转录因子家族包括2个TIFY蛋白、8个JAZ蛋白、6个ZML蛋白、5个PPD蛋白;蛋白互作预测发现,JAZ家族成员对JA信号有重要的调控作用。本研究对BvTIFY基因的结构与功能进行分析,发掘出甜菜根中应答盐胁迫基因BvTIFY13与BvTIFY15,为后续BvTIFY基因的功能研究提供一定理论基础。
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| 关 键 词： | 甜菜 转录因子 TIFY家族 全基因组鉴定 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021-08-31 |
TIFY Gene Family in Sugar Beet: Whole Genome Identification and Bioinformatics Analysis |
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| GONG Yongyong,DUANMU Huizi.TIFY Gene Family in Sugar Beet: Whole Genome Identification and Bioinformatics Analysis[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2022,38(8):17-24. |
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| Authors: | GONG Yongyong DUANMU Huizi |
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| Institution: | 1.Engineering Research Center of Agricultural Microbiology Technology, Ministry of Education, Heilongjiang University, Harbin 150500;2.Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Ecological Restoration and Resource Utilization for Cold Region, School of Life Sciences, Heilongjiang University, Harbin 150080;3.Key Laboratory of Molecular Biology, College of Heilongjiang Province, Harbin 150080 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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