基于线粒体16S rRNA基因序列的鳢属鱼类系统进化探讨 |
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引用本文: | 朱树人,孟庆磊,孙玉旋,张延华,朱永安.基于线粒体16S rRNA基因序列的鳢属鱼类系统进化探讨[J].长江大学学报,2015(27):25-29. |
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作者姓名: | 朱树人 孟庆磊 孙玉旋 张延华 朱永安 |
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作者单位: | 山东省淡水渔业研究院,山东省淡水水产遗传育种重点实验室,山东济南250017 |
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基金项目: | 上海高校知识服务平台项目,山东省农业良种工程项目,国家大宗淡水鱼产业技术体系项目 |
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摘 要: | 对4种鳢属(Channa)鱼类共108个个体的16SrRNA基因进行PCR扩增,经比对校正得到572bp(C.striata)和573bp(C.argus,C.maculata,C.asiatica)的基因片段,共检测到10个单倍型,4种鳢所有单倍型之间共存在1个插入/缺失;此外有63个变异位点,其中简约信息位点60个,序列表现出明显的A偏倚;多态位点比例为11.2%;序列中转换多于颠换,转换/颠换之比为1.4。基于Kimura双参数法,计算的种间遗传距离介于0.021乌鳢(C.argus)与斑鳢(C.maculata)之间]到0.079乌鳢(C.argus)与线鳢(C.striata)之间、斑鳢(C.maculata)与线鳢(C.striata)之间]。以非洲真副鳢(Parachanna insignis)为外群构建的NJ树和ML树中,线鳢位于进化树的基部,表明线鳢是最早分化出来的种;进化树显示乌鳢和斑鳢亲缘关系最近,表明2个种分化较晚。
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关 键 词: | 线粒体DNA 16S rRNA 鳢属 系统进化 |
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