| 芍药内外花瓣发育形成相关基因片段的生物信息学及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 吴彦庆,汤寓涵,赵大球,陶俊.芍药内外花瓣发育形成相关基因片段的生物信息学及组织表达分析[J].中国农业大学学报,2017,22(12):53-63. |
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| 作者姓名： | 吴彦庆 汤寓涵 赵大球 陶俊 |
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| 作者单位： | 扬州大学 动物科学与技术学院, 江苏 扬州 225009,扬州大学 园艺与植物保护学院, 江苏 扬州 225009,扬州大学 园艺与植物保护学院, 江苏 扬州 225009,扬州大学 动物科学与技术学院, 江苏 扬州 225009;扬州大学 园艺与植物保护学院, 江苏 扬州 225009 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31372097；31400592）；江苏省高校自然科学研究重大项目（13KJA210005） |
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| 摘 要： | 为揭示芍药内外花瓣形成的分子机制,以托桂型芍药品种‘紫凤羽’为材料,利用转录组测序筛选调控芍药花型发育的关键基因序列片段,首先通过生物信息学方法分析基因片段的蛋白结构与功能以及亚细胞定位,其次利用qPCR检测基因在花瓣中表达情况。结果显示,测序筛选出2个关键基因——AGAMOUS(AG)和MADSbox protein2(MADS2),蛋白分析表明两者均为脂溶亲水性不稳定蛋白,均无剪切信号肽和跨膜结构,为非分泌蛋白,二级结构均以α螺旋(Alpha helix)为主,三维结构模型极为相似,并且包含1个相同的保守功能域—MADS,很少信号肽分泌途径上;qPCR检测显示内瓣AG与MADS2表达量均极显著高于外瓣(P0.01)。芍药AG和MADS2蛋白结构功能、表达水平差异均存在一定的相似性,推测两者可能在芍药花瓣形成过程中发挥相同的生物学功能。
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| 关 键 词： | 芍药 托桂型 生物信息学 基因表达 |
| 收稿时间： | 2016/11/6 0:00:00 |
Bioinformatics and tissue expression analysis of genes affecting the formation and development of inner/outer petal in Paeonia lactiflora |
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| WU Yanqing,TANG Yuhan,ZHAO Daqiu and TAO Jun.Bioinformatics and tissue expression analysis of genes affecting the formation and development of inner/outer petal in Paeonia lactiflora[J].Journal of China Agricultural University,2017,22(12):53-63. |
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| Authors: | WU Yanqing TANG Yuhan ZHAO Daqiu and TAO Jun |
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| Institution: | Animal Science and Technology College, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China,College of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China,College of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China and Animal Science and Technology College, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China;College of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Paeonia lactiflora flower type bioinformatics gene expression |
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