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百合水通道蛋白LotNIP5-1基因的克隆及表达分析
引用本文:薛晓霞,邵杨,张克中,崔金腾.百合水通道蛋白LotNIP5-1基因的克隆及表达分析[J].中国农业大学学报,2017,22(3):23-31.
作者姓名:薛晓霞  邵杨  张克中  崔金腾
作者单位:北京农学院 园林学院, 北京 102206;北京农学院 园林学院, 北京 102206;北京农学院 园林学院, 北京 102206;北京农学院 园林学院, 北京 102206
基金项目:北京市科技提升计划(TJSHG201310020020);北京林果业生态环境功能提升协同创新中心(PXM2016-014207-000038);北京市属高等学校创新团队建设项目(IDHT20150503);城乡生态环境北京实验室项目(PXM2016-014207-000003)
摘    要:为研究NIP5-1基因(Nodulin26-like intrinsic protein)在百合生长发育方面的作用机理,利用RACE技术克隆得到百合NIP5-1基因的全长cDNA序列。运用多个软件进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及RT-PCR技术检测其表达特性。结果表明:1)百合NIP5-1基因全长为1 492bp,包含1个900bp的完整开放阅读框(Open reading frame,ORF),共编码299个氨基酸;2)百合NIP5-1蛋白属于跨膜通道蛋白MIP超家族。具有6个跨膜区;在B、E环分别具有NIP5-1蛋白特有的NPS、NPV模体,具有该蛋白Ar/R filter分子筛特有的AIGR模体;与小果野芭蕉、香瓜、葡萄、黄瓜、番茄的相似性分别为86%、83%、84%、83%和82%;3)荧光定量结果显示,百合NIP5-1基因在茎中表达量最高,在花瓣中表达量较低,在叶、鳞茎、根中表达量均极低。RTPCR半定量检测显示,其在"湿"柱头上表达量显著高于"干"柱头,这与转录组测序结果相符合。上述研究暗示,百合NIP5-1可能是硼酸通道蛋白,在促进茎生长及生殖活动中发挥作用。

关 键 词:百合  NIP5-1基因克隆  序列分析  表达分析
收稿时间:2016/8/24 0:00:00

Cloning and expression analysis of aquaporins LotNIP5-1 gene from lily
XUE Xiaoxi,SHAO Yang,ZHANG Kezhong and CUI Jinteng.Cloning and expression analysis of aquaporins LotNIP5-1 gene from lily[J].Journal of China Agricultural University,2017,22(3):23-31.
Authors:XUE Xiaoxi  SHAO Yang  ZHANG Kezhong and CUI Jinteng
Institution:College of Landscape Architecture, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China;College of Landscape Architecture, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China;College of Landscape Architecture, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China;College of Landscape Architecture, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China
Abstract:
Keywords:Lilium  NIP5-1 gene clone  sequence analysis  expression analysis
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