| 杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 夏煜琪,孙宇,刘志鑫,孙瑞青,杨楠,蒲金基,张贺.杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析[J].浙江农业学报,2022,34(5):984. |
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| 作者姓名： | 夏煜琪 孙宇 刘志鑫 孙瑞青 杨楠 蒲金基 张贺 |
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| 作者单位： | 1.海南大学 植物保护学院 热带作物学院,海南 海口 5702282.中国热带农业科学院 环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室,海南 海口 5711013.中国热带农业科学院 热带生物技术研究所,海南 海口 571101 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2019YFD1000504);中国热带农业科学院基本科研业务费(1630032022007);杧果病虫害监测与防治项目 |
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| 摘 要： | BES1/BZR1是植物中特有的一类转录因子且是油菜素内酯(BR)信号转导途径的唯一转录因子,为探讨其在植物抗病抗逆反应中的作用,本研究通过运用生物信息学研究方法分析了杧果BES1s家族成员的理化性质、结构域、蛋白质结构和在不同胁迫条件下的基因表达。研究表明,杧果BES1s家族理化性质预测结果显示,成员外显子个数相差较大;结构域预测结果显示,杧果BES1s成员均具有BES1_N结构域;系统进化分析和二级结构表明,成员可分成3组,不同组之间成员存在较大差异、蛋白质三级结构预测结果显示,存在3种结构。在qRT-PCR法测定基因表达量中发现,在胶孢炭疽菌(Cg)侵染过程中MiBES1.1和MiBES1.5持续上调表达;MiBES1.12和MiBES1.13持续下调表达。在细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,在12 h时除MiBES1.7和MiBES1.9,其他成员上调表达;在3 h时MiBES1.1~MiBES1.5和MiBES1.11下调表达。在茉莉酸甲酯(MeJA)处理过程中,MiBES1.7、MiBES1.9和MiBES1.2持续下调表达;在48 h时,除MiBES1.5和MiBES1.11~MiBES1.13其他成员下调表达。本研究结果可为杧果BES1s家族成员基因的功能研究提供依据。
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| 关 键 词： | 转录因子 杧果 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021-03-15 |
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