| 青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析 |
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| 引用本文： | 李广祯,马志杰,陈生梅,林元,李瑞哲,刘书杰,杨国太,周桑加.青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析[J].中国牛业科学,2021,47(6):41-46. |
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| 作者姓名： | 李广祯 马志杰 陈生梅 林元 李瑞哲 刘书杰 杨国太 周桑加 |
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| 作者单位： | 青海大学畜牧兽医科学院,青海大学畜牧兽医科学院,青海大学畜牧兽医科学院,青海省同德县农牧和水利局,青海大学畜牧兽医科学院,青海大学畜牧兽医科学院,青海省同德县农牧和水利局,青海省同德县农牧和水利局 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31960656）；中国科学院“西部之光”人才培养引进计划（“西部青年学者”）项目（3-1） |
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| 摘 要： | 【目的】为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。【方法】本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记（SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10）和1个Y-STR标记（INRA189）进行PCR扩增、测序和分型，使用BioEdit、Arlequin和Network等生物信息学软件综合分析同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。【结果】32头同德牦牛5个Y-SNPs标记即SRY4（969bp）、USP9Y（470bp）、UTY19（290bp）、AMELY3（971bp）和OFD1Y10（763bp）的PCR扩增产物测序长度与先前研究结果一致，INRA189标记分型分析共检测到155bp、157bp和159bp 3个等位基因；在同德牦牛群体AMELY3标记中检测到一个新的Y-SNP位点（即g.719 C>T）；基于5个Y-SNPs标记11个Y-SNPs位点和INRA189标记3个等位基因的联合分型，共确定了6种Y染色体单倍型（即Y1H1、Y1H2、Y1H3、Y1H4、Y1H5和Y2H6），Y染色体单倍型多样度（Hd）为0.714±0.060，表明同德牦牛具有丰富的父系遗传多样性；系统发育分析显示同德牦牛由2个父系支系组成（即Y1和Y2），提示其拥有2个父系起源。【结论】同德牦牛拥有特殊的父系遗传信息，具有丰富的父系遗传多样性，由2个父系支系组成，拥有2个父系起源。
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| 关 键 词： | 牦牛 Y-SNP Y-STR 父系遗传多样性 群体遗传结构 起源 |
| 收稿时间： | 2021/8/17 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/8/25 0:00:00 |
Analysis of paternal genetic diversity and genetic background of Tongde yak population in Qinghai province |
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| Liguangzhen,Mazhijie,Chenshengmei,Linyuan,Liruizhe,Liushujie,Yangguotai and Zhousangjia.Analysis of paternal genetic diversity and genetic background of Tongde yak population in Qinghai province[J].China Cattle Science,2021,47(6):41-46. |
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| Authors: | Liguangzhen Mazhijie Chenshengmei Linyuan Liruizhe Liushujie Yangguotai and Zhousangjia |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Yak Y-SNP Y-STR Paternal genetic diversity Population genetic structure Origin |
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