| 绵羊BMPR1B基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 焦丹,刘秀,李少斌,王继卿,闫伟,李文浩,罗玉柱.绵羊BMPR1B基因的生物信息学分析[J].甘肃农业大学学报,2016(4):1-6. |
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| 作者姓名： | 焦丹 刘秀 李少斌 王继卿 闫伟 李文浩 罗玉柱 |
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| 作者单位： | 甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃兰州730070 |
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| 基金项目： | 国际科技合作专项(2011DFG33310)，甘肃省创新研究群体计划(1210RJIA005)，国家科技支撑计划课题(2012BA D13B05) |
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| 摘 要： | 【目的】利用生物信息学软件对绵羊BMPR1B基因进行分析,并了解其功能和结构,为进一步探讨BMPR1B基因在绵羊生长繁殖以及绵羊卵泡生长和分泌和产羔率等研究奠定遗传信息基础.【方法】利用生物信息学对绵羊骨形态发生蛋白1β(bone morphogenetic protein 1beta,BMPR1B)基因的蛋白理化性质、亚细胞定位、潜在信号肽剪切位点、蛋白跨膜螺旋结构、糖基化和磷酸化位点、蛋白保守结构域、亲疏水性和编码产物进行功能预测分析,及其编码蛋白的二级结构和三级结构等进行分析预测.【结果】绵羊BMPR1B基因CDs编码蛋白质的502个氨基酸残基中,带电荷氨基酸、疏水氨基酸和极性氨基酸含量较高.相对分子量为56 907.4U,理论等电点pI为7.78;亚细胞主要定位于细胞核,不属于分泌蛋白;无信号肽序列;预测含有32个磷酸化位点和2个糖基化位点;存在一段跨膜结构且分别有一个GS和S-TKc的结构域,二级结构以无规卷曲为主.预测该蛋白在翻译和脂肪代谢过程中有着重要意义.【结论】绵羊BMPR1B蛋白包含502个氨基酸,为细胞核合成蛋白,该蛋白翻译后修饰的主要方式是磷酸化,在细胞内主要行翻译和脂肪代谢作用.蛋白二级结以无规卷曲为主,三级结构主要由α螺旋和无规卷曲缠绕折叠形成.
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| 关 键 词： | 绵羊 骨形态发生蛋白1β基因 生物信息学 |
Bioinformatics analysis of BMPR1B gene in sheep |
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