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杨树SABP2基因的克隆与分析
引用本文:董慧霞,理永霞,贾秀贞,等.杨树SABP2基因的克隆与分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2017,45(3):82-88,95.
作者姓名:董慧霞  理永霞  贾秀贞  
作者单位:中国林业科学研究院 院森林生态环境与保护研究所 国家林业局森林保护学重点实验室;河南师范大学 生命科学学院,中国林业科学研究院 林业新技术研究所;南京林业大学 南方现代林业协同创新中心,中国林业科学研究院 院森林生态环境与保护研究所 国家林业局森林保护学重点实验室;南京林业大学 南方现代林业协同创新中心
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(CAFYBB2016SY037)
摘    要:【目的】克隆84K杨水杨酸结合蛋白2(Salicylic acid-binding protein 2,SABP2)基因并预测其功能。【方法】以生长至5片小叶的84K杨组培苗为材料,提取其叶和茎的总RNA。根据毛果杨SABP2基因(GenBank序列号:XM_002310718.2)的完整CDs序列,设计84K杨SABP2基因的引物,采用RT-PCR技术扩增84K杨SABP2基因全长,然后连接到pGM-T克隆载体,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,对84K杨SABP2基因进行克隆,获得该基因的全长序列。通过各种在线软件对84K杨SABP2基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。【结果】84K杨基因的cDNA序列全长822bp,开放阅读框789bp,编码263个氨基酸。生物信息学分析表明,84K杨SABP2与毛白杨SABP2(GenBank序列号:JQ086570.1)的同源性最高,达98%;84K杨SABP2基因位于微体中;SABP2蛋白有11个蛋白质结合位点,属于α/β折叠水解酶家庭成员中的酯酶,为亲水性蛋白。【结论】成功克隆了84K杨的SABP2基因,其功能与前人对草本植物中SABP2部分功能的研究结果一致。

关 键 词:84K杨  水杨酸结合蛋白2(SABP2)基因  生物信息学
收稿时间:2015/11/30 0:00:00

Cloning and analysis of SABP2 gene about poplar
DONG Huixi,LI Yongxia and JIA Xiuzhen,et al.Cloning and analysis of SABP2 gene about poplar[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2017,45(3):82-88,95.
Authors:DONG Huixi  LI Yongxia and JIA Xiuzhen  
Abstract:
Keywords:84K poplar  salicylic acid binding protein 2 (SABP2)  bioinformatics
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