| 羊口疮病毒QD/2015株B2L基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李智,仲亮,张静,刘春羽,范俊豪,王海峰,牛云雷,张七斤.羊口疮病毒QD/2015株B2L基因克隆及生物信息学分析[J].中国动物检疫,2017,34(3):91-96. |
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| 作者姓名： | 李智 仲亮 张静 刘春羽 范俊豪 王海峰 牛云雷 张七斤 |
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| 摘 要： | 为分析羊口疮病毒(ORFV/QD/2015株)B2L基因的分子特征,预测其编码蛋白的生物学功能,对其B2L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学相关软件及方法,对扩增所得的基因进行序列分析,并对其编码蛋白的二级结构、细胞抗原表位、三级结构、跨膜结构域和信号肽等进行预测和分析。结果显示:ORFV/QD/2015株B2L基因序列长1 137 bp,编码379个氨基酸;该毒株与其他12株羊口疮病毒参考株的B2L基因核苷酸序列同源性为96.8%~99.7%,氨基酸序列同源性为96.8%~99.2%。系统进化分析显示,ORFV/QD/2015株与2015年分离到的ORFV/Shaan Xi/2015/China株亲缘关系最近;B2L基因编码蛋白二级结构以α-螺旋区域和β-折叠区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在7个细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域;三级结构呈弯曲状螺旋结构。
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| 关 键 词： | 羊口疮病毒 B2L基因 生物信息学分析 蛋白结构预测 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of B2L Gene of Orf Virus QD/2015 Strain |
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| Li Zhi,Zhong Liang,Zhang Jing,Liu Chunyu,Fan Junhao,Wang Haifeng,Niu Yunlei,Zhang Qijin.Cloning and Bioinformatic Analysis of B2L Gene of Orf Virus QD/2015 Strain[J].China Journal Of Animal Quarantine,2017,34(3):91-96. |
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| Authors: | Li Zhi Zhong Liang Zhang Jing Liu Chunyu Fan Junhao Wang Haifeng Niu Yunlei Zhang Qijin |
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