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决明异分支酸合酶基因的克隆及表达分析
引用本文:李关荣,艾 义,谭 燕,米 瑶,朱林蕙,李培江,齐红艺.决明异分支酸合酶基因的克隆及表达分析[J].西南农业大学学报,2014,36(9):1-8.
作者姓名:李关荣  艾 义  谭 燕  米 瑶  朱林蕙  李培江  齐红艺
作者单位:1. 西南大学农学与生物科技学院,重庆400716;2. 西南大学药学院,重庆400716
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81202946);111 计划课题资助项目(104510 205001);重庆市自然科学基金资助项目(CSTC2008BB5259).
摘    要:异分支酸合酶(Isochorismate synthase,ICS)控制着分支酸到异分支酸衍生的各种产物的分配,据报道它是植物体内蒽醌类物质合成的限速酶.该文采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆其基因全长(SoICS);以荧光定量PCR(FQ-PCR)测定其在植株各部位的表达谱并考察其与蒽醌质量分数的关系.结果表明,SoICScDNA全长为2 103bp(GenBank Accession KF547925);有多个非典型的加尾信号;含一个总长为1 713bp的完整阅读框,编码570个氨基酸;SoICS含有AtICS1和AtICS2中与ICS催化活性相关的5个保守关键氨基酸残基;其N-端有48个氨基酸残基的推定前导序列;具有典型的保守分支酸结合结构域;有多个显著磷酸化位点;其蛋白质三维结构是一个紧凑型球状结构;系统分析显示,决明ICS与蓖麻、毛果杨和山杨的ICS关系较近.FQ-PCR分析表明,ICS基因在叶中表达水平最高,其次为茎、荚果皮、幼果和种子,在根和花中的表达量最低;总蒽醌、游离蒽醌和结合蒽醌质量分数的相关性达到极显著水平,但SoICS转录本表达量和蒽醌质量分数之间没有达到显著相关水平.

关 键 词:钝叶决明  异分支酸合酶  基因克隆  生物信息学分析  表达分析
收稿时间:2014/5/21 0:00:00

The Cloning and Expressional Analysisof Isochorismate Synthase Geneof Senna obtusifolia
LI Guan-rong,AI Yi,TAN Yan,MI Yao,ZHU Lin-hui,LI Pei-jiang,QI Hong-yi.The Cloning and Expressional Analysisof Isochorismate Synthase Geneof Senna obtusifolia[J].Journal of Southwest Agricultural University,2014,36(9):1-8.
Authors:LI Guan-rong  AI Yi  TAN Yan  MI Yao  ZHU Lin-hui  LI Pei-jiang  QI Hong-yi
Abstract:
Keywords:
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