猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-la株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究 |
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引用本文: | 刘光清,薛强,仇华吉,蔡雪晖,童光志,郭宝清.猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-la株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究[J].中国预防兽医学报,2002,24(2):81-87. |
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作者姓名: | 刘光清 薛强 仇华吉 蔡雪晖 童光志 郭宝清 |
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作者单位: | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150001 |
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基金项目: | 本研究由国家重点基础研究发展规划项目(973,批准号:1999011902)和国家自然科学基金(批准号:30000122)资助 |
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摘 要: | 对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析。结果表明,CH-1a株ORF1全长11882nt,其中ORF1a长7512nt、ORF1b长4374nt。它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%。ORF1编码两个聚合蛋白,其中ORF1a编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白(Nsp1α、Nsp1β、Nsp2-5),以Nsp2的变异性最为显著,它与LV株的氨基酸同源性为41%。ORF1b编码的聚合蛋白经裂解后,产生4个成熟的非结构蛋白(RdRp,CP2-4),其中RdRp为病毒的复制酶,CP4表现出较大的变异性,与LV株的氨基酸同源性为48%。在ORF1a-ORF1b的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构,它们是核糖体移码翻译所必需的结构。在基因组末端存在非编码区,其中5'NCR长190nt,比LV株5'NCR短31nt,其核苷酸同源性为61%。3'NCR长151nt,比LV株3'NCR长37nt,保守性稍高,其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%。在3'NCR末端有一个poly(A)尾巴,长20nt。在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列,是复制酶识别并结合的区域。本研究进一步证实CH-1a株在基因型上属于北美洲型。
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关 键 词: | 猪 繁殖 呼吸综合征病毒 CH-1a株 非结构基因 分子克隆 基因特征 序列分析 非结构蛋白编码区 |
文章编号: | 1008-0589(2002)02-0081-07 |
修稿时间: | 2001年6月26日 |
Molecular Cloning and Sequence Analysis of the NSP Coding Region of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus CH-la Strain |
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Abstract: | |
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Keywords: | PRRSV |
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