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黑皮冬瓜NBS类抗病基因同源序列克隆与分析
引用本文:赵芹,谢大森,何晓明,罗少波,李明珠.黑皮冬瓜NBS类抗病基因同源序列克隆与分析[J].热带作物学报,2014,35(10):2071-2077.
作者姓名:赵芹  谢大森  何晓明  罗少波  李明珠
作者单位:广东省农业科学院蔬菜研究所,广东广州,510640
基金项目:国家自然科学青年基金(No. 31311643);广东省自然科学基金(No. 10451064001006063);广州市珠江科技新星项目(No. 2013086)。
摘    要:以黑皮冬瓜"B98K"种质为试材,根据已克隆的植物NBS类抗病基因保守结构域设计简并引物,PCR扩增冬瓜基因组DNA,获得对应区段的DNA片段,回收克隆与测序后,得到19条抗病同源序列(命名为DNB1至DNB19)。利用DNAStar软件进行序列分析及同源性比对发现,这些抗病同源序列长度在249~252 nt之间,其核苷酸序列同源性在48.4%~98.8%之间,氨基酸序列同源性为23.2%~100.0%,推导氨基酸序列具有P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)典型的NBS保守结构域。同源进化分析将其全部归为non TIR-NBS-LRR类,与推导氨基酸序列多重比较结果一致;该序列与其他作物已克隆抗病基因的氨基酸序列同源性在24.7%~99.0%之间。该组序列已登录Genbank,登录号为KF776401~KF776419。

关 键 词:冬瓜  NBS  抗病同源序列  同源克隆  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of NBS Type Resistant Gene Analogs from Black Wax Gourd(Benincasa hispida)
ZHAO Qin,XIE Dasen,HE Xiaoming,LUO Shaobo and LI Mingzhu.Cloning and Sequence Analysis of NBS Type Resistant Gene Analogs from Black Wax Gourd(Benincasa hispida)[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(10):2071-2077.
Authors:ZHAO Qin  XIE Dasen  HE Xiaoming  LUO Shaobo and LI Mingzhu
Institution:Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences
Abstract:
Keywords:Ax gourd  NBS  Resistance gene analogs  Homologous clone  Sequence analysis
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