| gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞转录组的影响 |
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| 引用本文： | 余祖华,贾艳艳,何雷,廖成水,李静,魏颖,陈建,陈松彪,尚珂,丁轲.gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞转录组的影响[J].畜牧兽医学报,2023,54(2):663-672. |
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| 作者姓名： | 余祖华 贾艳艳 何雷 廖成水 李静 魏颖 陈建 陈松彪 尚珂 丁轲 |
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| 作者单位： | 1. 洛阳活载体生物材料与动物疫病重点实验室, 洛阳 471003;2. 河南科技大学功能微生物与畜禽健康实验室, 洛阳 471003;3. 河南科技大学动物科技学院, 洛阳 471003 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（U1504308；31702207）；河南科技大学省部级科技创新平台培育项目（2015SPT004） |
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| 摘 要： | 旨在探讨gga-miR-155对马立克病病毒转化的肿瘤细胞系MDCC-MSB1细胞转录组水平变化的影响。本研究以MDCC-MSB1细胞为研究对象，首先将gga-miR-155模拟物及其阴性对照转染MDCC-MSB1细胞，在转染后48 h提取总RNA，用安捷伦2100核酸检测仪分析各组细胞总RNA的完整性，采用RT-qPCR分析gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞中的过表达情况；然后利用高通量测序技术，分析gga-miR-155过表达后MDCC-MSB1细胞转录水平的变化，筛选差异表达基因，结合生物信息学分析预测差异表达基因中gga-miR-155靶mRNA。结果显示：制备了gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞过表达样本并构建了高通量测序文库；与对照组相比，gga-miR-155过表达组的差异表达基因有87个，其中，上调表达的基因有47个，下调表达的基因有40个；GO与KEGG分析显示，这些差异表达基因显著富集于代谢和蛋白结合过程/信号通路；通过Targetscan和miRada软件预测下调表达基因中鸡BACH1为gga-miR-155的靶mRNA （P<0.05）。综上，过表达gga-miR-155可调控MDCC-MSB1细胞的转录组水平，差异表达基因中BACH1基因可能在gga-miR-155的作用下参与了MDCC-MSB1细胞的代谢过程。
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| 关 键 词： | gga-miR-155 马立克病 MDCC-MSB1细胞 转录组 |
| 收稿时间： | 2022-07-01 |
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