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北方白菜型冬油菜BrFLC家族的全基因组鉴定、克隆及表达分析
引用本文:姚彦林,马骊,刘丽君,李学才,李鹏,王旺田,蒲媛媛,牛早霞,徐芳,孙万仓,武军艳.北方白菜型冬油菜BrFLC家族的全基因组鉴定、克隆及表达分析[J].中国油料作物学报,2023,45(1):83.
作者姓名:姚彦林  马骊  刘丽君  李学才  李鹏  王旺田  蒲媛媛  牛早霞  徐芳  孙万仓  武军艳
作者单位:1.甘肃农业大学农学院/甘肃省油菜工程技术研究中心,甘肃 兰州,7300702.省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃 兰州,7300703.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州,730070
基金项目:甘肃省自然科学基金(20JR10RA535);财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(CARS-12);省部共建干旱生境作物学国家重点实验室(甘肃农业大学)主任基金课题(GSCS-2020-Z1)
摘    要:春化过程是冬性植物抽薹开花前的主要阶段。FLC(FLOWERING LOCUS C)基因在春化过程中可以整合上游信号调控植物开花。为了解白菜型冬油菜中FLC基因的特征及其春化功能,以6个拟南芥FLC基因为索引从白菜型冬油菜基因组中鉴定得到10个BrFLC基因,其中8个均含有7个外显子。10个BrFLC分布于4条染色体上,存在明显的基因复制现象。进化及保守结构分析显示聚为一类的成员蛋白质保守Motif分布相似。基因上游1500 bp的启动子区域均含有光应答元件,其中BrFLC4、BrFLC5BrFLC6含低温响应元件,BrFLC3、BrFLC4、BrFLC7、BrFLC9含激素响应元件。比对发现,位于A02上的BrFLC6基因序列与大白菜中已注释的Bra031886差异性较大。克隆到陇油6号、陇油17、天油2号和天祝小油菜中的BrFLC6基因,序列相似性达99.5%。分析其中序列差异最大的BrFLC6基因,qRT-PCR检测发现它可在根、茎、叶、花蕾及花中表达;春化处理后则表达下调,不同品种间下调幅度有差异。结合春化率的观察,认为春化过程抑制了BrFLC6的表达,且基因表达水平与白菜型冬油菜通过春化所需的时间有关。

关 键 词:白菜型冬油菜  FLC转录因子  生物信息学分析  基因克隆  表达分析  
收稿时间:2022-05-09
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