| A型塞内卡病毒感染PK-15细胞环状RNA表达谱分析 |
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| 引用本文： | 陈彦希,王晨,罗愿,周远成,徐志文,彭远义,宋振辉,刘骁.A型塞内卡病毒感染PK-15细胞环状RNA表达谱分析[J].中国畜牧兽医,2023,50(1):280-289. |
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| 作者姓名： | 陈彦希 王晨 罗愿 周远成 徐志文 彭远义 宋振辉 刘骁 |
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| 作者单位： | 1. 西南大学动物医学院, 重庆 400799;2. 四川省畜牧科学研究院, 成都 610066;3. 四川农业大学动物医学院, 成都 611130 |
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| 基金项目： | 重庆市基础前沿面上项目（cstc2020jcyj-msxmX0786）；四川省区域创新合作科研项目（2022YFQ0023）；西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室开放课题（SKLSGB-ORP202104） |
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| 摘 要： | 【目的】分析A型塞内卡病毒(Seneca virus A,SVA)感染猪肾上皮细胞(PK-15)后环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱的变化，探究circRNAs在SVA感染过程中发挥的潜在调控作用。【方法】本研究基于Illumina HiSeq 2000平台对SVA感染及对照PK-15细胞circRNAs转录组进行测序，并对差异表达circRNAs的来源基因进行GO功能及KEGG通路富集分析，通过实时荧光定量PCR对新发现的circRNAs进行表达水平鉴定。【结果】转录组测序结果显示，SVA感染组、PK-15细胞对照组中共有432种circRNAs被发现。在SVA感染PK-15细胞中，87种circRNAs表达水平相对对照组PK-15细胞显著上调，74种circRNAs表达水平显著下调。对差异表达circRNAs的来源基因进行GO功能注释分析表明，SVA感染组差异表达circRNAs来源基因主要富集于核仁、细胞器膜和细胞大分子代谢、发育等生理过程。KEGG通路富集结果显示，SVA感染组差异表达circRNAs来源基因主要富集于胞吞过程、cAMP信号通路、Rap...
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| 关 键 词： | 环状RNA(circRNA) A型塞内卡病毒(SVA) 高通量测序 PK-15细胞 |
| 收稿时间： | 2022-08-16 |
circRNA Expression Profile Analysis of PK-15 Cells Response to Seneca Virus A Infection |
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| CHEN Yanxi,WANG Chen,LUO Yuan,ZHOU Yuancheng,XU Zhiwen,PENG Yuanyi,SONG Zhenhui,LIU Xiao.circRNA Expression Profile Analysis of PK-15 Cells Response to Seneca Virus A Infection[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2023,50(1):280-289. |
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| Authors: | CHEN Yanxi WANG Chen LUO Yuan ZHOU Yuancheng XU Zhiwen PENG Yuanyi SONG Zhenhui LIU Xiao |
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| Institution: | 1. College of Veterinary Medicine, Southwestern University, Chongqing 400799, China;2. Sichuan Academy of Animal Husbandry Science, Chengdu 610066, China;3. College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | circular RNA (circRNA) Seneca virus A (SVA) high-throughput sequencing PK-15 cell |
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