| 基于小RNA深度测序技术的苜蓿病毒病鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 杜江,马振男,王晨燕,张丽,王德富,牛颜冰.基于小RNA深度测序技术的苜蓿病毒病鉴定与分析[J].草业学报,2023(12):115-125. |
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| 作者姓名： | 杜江 马振男 王晨燕 张丽 王德富 牛颜冰 |
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| 作者单位： | 1. 山西农业大学生命科学学院;2. 山西农业大学草业学院 |
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| 基金项目： | 山西农业大学科技创新基金（2020BQ51）；;山西省高等学校科技创新项目（2021L172）；;国家现代农业产业技术体系项目（CARS-21）资助； |
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| 摘 要： | 紫花苜蓿是一种重要的牧草，然而紫花苜蓿病毒病的侵染严重影响其品质。本研究通过小RNA深度测序技术和RT-PCR/PCR的方法对采自山西农业大学植物园中表现花叶、皱缩、卷曲的紫花苜蓿样品进行病毒病原的鉴定，结果表明病样被苜蓿花叶病毒（AMV）、豌豆线条病毒（PeSV）、苜蓿矮化病毒（ADV）和苜蓿卷叶病毒（ALCV）4种病毒复合侵染。PCR扩增获得了ALCV山西太谷紫花苜蓿分离物SXTG(OP748371)的全基因组序列，分析表明该分离物与ALCV阿根廷紫花苜蓿分离物Colonia Dora(MG792026)的序列相似性最高，达到97.34%。对扩增获得的AMV CP基因（OP748369）核苷酸序列及其编码的氨基酸序列进行序列比对分析显示，AMV山西太谷紫花苜蓿分离物SX与阿根廷紫花苜蓿AMV分离物ACat(MW835977)相似性最高，核苷酸和氨基酸相似性分别为99.24%和99.54%。同样将扩增获得的ADVCP基因序列上传至GenBank获得登录号OP957285，命名为ADV山西太谷紫花苜蓿分离物（SXJZ），通过序列分析表明该分离物与ADV分离物N1(MZ221810)亲缘...
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| 关 键 词： | 紫花苜蓿 苜蓿花叶病毒 苜蓿卷叶病毒 苜蓿矮缩病毒 豌豆线条病毒 序列分析 |
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