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甜瓜属野生种铝胁迫诱导基因ChAI的克隆及序列分析
引用本文:魏跃,王永平,王全智,史红林,薄凯亮,陈劲枫.甜瓜属野生种铝胁迫诱导基因ChAI的克隆及序列分析[J].核农学报,2010,24(6):1286-1290.
作者姓名:魏跃  王永平  王全智  史红林  薄凯亮  陈劲枫
作者单位:1. 江苏农林职业技术学院,江苏,镇江,212400;南京农业大学,南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,江苏,南京,210095
2. 江苏农林职业技术学院,江苏,镇江,212400
3. 南京农业大学,南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,江苏,南京,210095
基金项目:国家自然科学基金重点项目,国家自然科学基金,国家高技术研究发展计划863专项经费项目
摘    要:应用同源序列克隆策略从铝盐胁迫处理的甜瓜属野生种(Cucumis hystrix Chakr.) 叶片中获得了612bp的片段,通过在EST数据库进行同源检索,发现一条甜瓜EST序列(GenBank登录号:AM724963.2)与之高度同源,据此设计引物并经RT-PCR扩增和序列拼接,最后获得了铝诱导基因cDNA序列全长,命名为ChAI (GenBank登录号:FJ968438 )。序列分析表明该基因全长967bp,其中开放读码框(ORF)长711bp编码236个氨基酸组成的多肽,5′ 和3′ 端非编码区长度各为15bp和241bp。DNAMAN同源性分析表明该基因与葡萄、棉花、羊乳(轮叶党参)、白骨壤(真红树植物)、拟南芥等植物的铝诱导蛋白的氨基酸序列具有78.6%以上的同源性。运用半定量RT-PCR技术对ChAI 基因的转录水平进行分析,根据该基因在铝胁迫下大量表达推测ChAI 与耐铝盐胁迫响应相关,但具体耐铝胁迫机制还有待深入研究。

关 键 词:甜瓜属野生种  表达序列标签  克隆  铝诱导

CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF ALUMINUM-INDUCED GENE ChAI FROM THE WILD CUCUMIS SPECIES (Cucumis hystrix Chakr.)
WEI Yue,WANG Yong-ping,WANG Quan-zhi,SHI Hong-lin,BO Kai-liang,CHEN Jin-feng.CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF ALUMINUM-INDUCED GENE ChAI FROM THE WILD CUCUMIS SPECIES (Cucumis hystrix Chakr.)[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2010,24(6):1286-1290.
Authors:WEI Yue  WANG Yong-ping  WANG Quan-zhi  SHI Hong-lin  BO Kai-liang  CHEN Jin-feng
Institution:1.Jiangsu Polytechnic College of Agriculture and Forestry, Zhenjian, Jiangsu   212400; 2.Key Laboratory of Southern Vegetable Crop Genetics Improvement, Nanjing Agricultural University, Nanjing,Jiangsu   210095
Abstract:
Keywords:Cucumis hystrix Chakr    expressed sequence tags  clone  aluminum-induced
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