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利用Insertion/Deletion(InDel)分子标记检测玉米互交种混杂的原理及应用
引用本文:葛敏,蒋璐,张晓林,赵涵,张体付.利用Insertion/Deletion(InDel)分子标记检测玉米互交种混杂的原理及应用[J].分子植物育种,2013(1):37-47.
作者姓名:葛敏  蒋璐  张晓林  赵涵  张体付
作者单位:江苏省农业科学院农业生物技术研究所,江苏省农业生物学重点实验室;南京农业大学
基金项目:江苏省青年基金项目(BK2012375);江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(12)5020]共同资助
摘    要:尽管分子标记广泛用于玉米品种纯度鉴定,但由于互交种基因组具有相同的基因,现有的分子标记技术尚不能对互交种的混杂进行有效判定。本研究基于玉米互交种胚乳等位基因二倍剂量关系,利用Insertion/Deletion(InDel)标记在PCR指数扩增期对等位基因扩增相对量的观察值与理论值进行统计分析,通过概率对互交种进行判定。经过筛选,亲本B73、Mo17间存在共显性差异的8个InDel标记中,5个标记的PCR扩增质量满足互交种样本(正交种:B73×Mo17,反交种:Mo17×B73)的鉴定要求。这些标记以不同的循环数进行PCR扩增,发现37个循环是处于指数扩增期的最佳鉴定时期。同一标记在每个样本中以37个循环数进行3次扩增重复,统计分析发现:不同标记在杂交种叶片DNA中等位基因扩增相对量与理论比1的统计概率值从6.50E-08到1.000不等,证实标记在等位基因间的扩增效率并不完全一致。对互交种胚乳等位基因扩增相对量进行卡方测验,4个InDel标记能够对互交种样本进行准确区分,所得概率符合判定标准。标记110仅能准确判定正交种,对反交种样本的统计概率不满足反交种判定的概率标准。结果显示,该分子标记方法可成功用于玉米互交种的判定。

关 键 词:插入/缺失  分子标记  正交  反交  纯度鉴定  玉米

The Principle of Distinguishing Maize Hybrids of Direct and Reciprocal Crosses Using Insertion/Deletion (InDel) Markers and Its Application
Ge Min, Jiang Lu, Zhang Xiaolin,Zhao Han,Zhang Tifu.The Principle of Distinguishing Maize Hybrids of Direct and Reciprocal Crosses Using Insertion/Deletion (InDel) Markers and Its Application[J].Molecular Plant Breeding,2013(1):37-47.
Authors:Ge Min  Jiang Lu  Zhang Xiaolin  Zhao Han  Zhang Tifu
Institution:1** 1 Institute of Biotechnology, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Provincial Key Laboratory of Agrobiolgy, Nanjing, 210014; 2 Nanking Agricultural University, Nanjing, 210095
Abstract:
Keywords:
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