籼稻品种Kasalath BAC克隆的终端序列分析和染色体制图 |
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引用本文: | 谢国禄.籼稻品种Kasalath BAC克隆的终端序列分析和染色体制图[J].作物育种信息,2005(8):11. |
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作者姓名: | 谢国禄 |
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摘 要: | 为了调查水稻种(Oryza sativa)内的表型多样性和进化关系,我们对衍生于籼稻品种Kasalath的BAC(细菌性人工染色体)克隆进行了大范围的终端排序和染色体in silico制图(根据序列同源性进行制图)。从47194个BAC克隆中总共获得了78427个高质量的BAC-终端序列(BES);这些终端序列表现出总共具有37.8Mb基因组序列的482bp的平均阅读长度。排除含有重复序列的这些BES并使用粳稻品种日本晴的高质量基因组序列作为参照标准后,把这些具有成对BES的12170个克隆绘制到了12条染色体上。这些克隆由4.50个重叠群组成,
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关 键 词: | BAC克隆 人工染色体 籼稻品种 序列分析 终端 制图 基因组序列 表型多样性 序列同源性 |
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