| 我国地方鸡种CYP21A2基因外显子1序列比较分析 |
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| 引用本文： | 姜庆林,张宜辉,尹召华,俞步清,姚新年,张莘,毕瑜林,陈国宏.我国地方鸡种CYP21A2基因外显子1序列比较分析[J].中国家禽,2019(19):68-70. |
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| 作者姓名： | 姜庆林 张宜辉 尹召华 俞步清 姚新年 张莘 毕瑜林 陈国宏 |
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| 作者单位： | 扬州大学实验农牧场;扬州大学动物科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2018YFD0501503);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(18)1004) |
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| 摘 要： | 为了探究CYP21A2基因在鸡中的遗传多样性,对25个地方鸡品种的CYP21A2基因外显子1序列进行目标捕获测序,以红色原鸡(Gallusgallus)为标准基因库,并用MEGA6软件对25个鸡种CYP21A2基因外显子1序列进行对比分析,筛选CYP21A2基因外显子1的SNPs位点和Indels位点,以及氨基酸对应的变化,最后运用邻接法构建进化树进行聚类分析。结果显示:在25个品种中有2个SNPs位点和1个Indels位点;在36bp处的SNP1,由G→C,为同义突变;在119bp处的SNP2,由G→A,为错义突变,编码的氨基酸由谷氨酰胺突变为精氨酸;聚类分析显示25个鸡种大致分为3类,其中AA鸡单独为一类,安卡鸡、SPF来航鸡和广西黄鸡等12个鸡种聚为一类,其余12个鸡种聚为一类,表明AA鸡CYP21A2基因外显子1为单独起源。综上分析,我国地方鸡品种中CYP21A2基因外显子1具有丰富的遗传多样性,在抗病性和免疫能力不同的鸡品种间存在差异,提示其与我国地方鸡种的先天免疫功能和抗病有关。
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| 关 键 词： | 鸡 CYP21A2基因 SNPS INDELS 系统进化树 地方鸡种 |
Comparative Analysis of CYP21A2 Gene Exon1 Sequences in Local Chicken Breeds in China |
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| Abstract: | JIANG Qinglin;ZHANG Yihui;YIN Shaohua |
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