| 草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因vv-gpx01的序列特征及表达分析 |
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| 引用本文： | 严俊杰,郭丽,赵静静,谢宝贵.草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因vv-gpx01的序列特征及表达分析[J].吉林农业大学学报,2014(5). |
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| 作者姓名： | 严俊杰 郭丽 赵静静 谢宝贵 |
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| 作者单位： | 福建农林大学菌物研究中心,福州,350002 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目 |
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| 摘 要： | 依托草菇基因组及转录组数据,克隆得到1个谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)编码基因,命名为vvgpx01。ZOOM软件的分析结果表明:该基因全长1 313 bp,含有4个外显子、3个内含子,编码228个氨基酸;5'端非翻译区长为12 bp,3'端非翻译区为452 bp;其中3个内含子在RNA加工过程中均存在保留现象。生物信息学分析结果表明:草菇的GPx01序列具备完整的谷胱甘肽过氧化物酶保守结构域;系统发育树显示,担子菌与子囊菌的GPx分别聚在了2个不同的分支上,草菇GPx01与双孢蘑菇亲缘关系较近并与其他伞菌目的真菌聚在1个分支上。另外,由内含子保留所产生的氨基酸序列均出现了不同程度的功能域缺失,这将导致谷胱甘肽过氧化物酶的失活。表达谱分析结果表明:vv-gpx01在整个草菇生长阶段都有表达,但表达量存在差异。推测,草菇GPx01可能通过可变剪接产生不同的转录本,通过调节不同转录本的表达水平来调控基因功能域的翻译水平及空间构型,最终实现酶活性的调节。
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| 关 键 词： | 草菇 谷胱甘肽过氧化物酶 可变剪接 基因结构 系统进化 差异表达 |
Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea |
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| YAN Jun-jie,GUO Li-xian,ZHAO Jing-jing,XIE Bao-gui.Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea[J].Journal of Jilin Agricultural University,2014(5). |
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| Authors: | YAN Jun-jie GUO Li-xian ZHAO Jing-jing XIE Bao-gui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | straw mushroom glutathione peroxidase alternative splicing gene structure phyletic evolution differential expression |
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