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基于SSR荧光标记的白蜡核心种质构建
引用本文:燕丽萍,吴德军,毛秀红,姚俊修,任飞,李善文,王开芳,王因花,刘翠兰.基于SSR荧光标记的白蜡核心种质构建[J].中南林业科技大学学报,2019(7):1-9.
作者姓名:燕丽萍  吴德军  毛秀红  姚俊修  任飞  李善文  王开芳  王因花  刘翠兰
作者单位:山东省林业科学研究院;山东省林木遗传改良重点实验室
基金项目:国家“十二五”科技支撑计划专题:“白蜡种质资源发掘与创新利用”(2013BAD01B06-6);山东省科技发展计划项目:“白蜡种质资源分子评价与体胚发育技术研究”(2014GNC111006)
摘    要:白蜡为中国北方重要的盐碱地造林树种,研究其遗传多样性,进一步构建核心种质,对白蜡优异种质的筛选及开发利用具有重要作用,为广泛开展白蜡种质资源的保存评价、挖掘优异基因资源提供核心材料,同时也为白蜡育种提供优良基因资源。本研究运用SSR标记的方法,选取田间表型性状差异较大的4个白蜡品种华雄、鲁蜡5号、金叶白蜡和金枝白蜡,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳从500对SSR引物中筛选出扩增条带清晰、多态性好、扩增稳定的42对引物。从筛选出的每对引物5′端添加荧光标记后,采用毛细管法通过DNA分析仪检测202个样品不同等位变异的扩增片段,从42对SSR引物中筛选出17对扩增稳定的引物,建立基于高通量荧光SSR标记的白蜡种质鉴定体系。研究了来自全国22个地区的具有代表性的202份白蜡种质资源的遗传多样性,通过R语言包Genetic Subsetter构建出了40份白蜡核心种质。结果表明:选用的17对引物都表现出多态性,共检测出142个等位变异,平均每对引物等位基因数为8.353个;平均有效等位基因数为3.342;平均多态性信息含量为0.635。可见白蜡属植物种间变异较大,具有丰富的遗传多样性。构建了40份白蜡核心种质,占原始种质的20%,t检测表明,所构建的核心种质遗传多样性丰富,其代表的遗传多样性指标与原始种质资源差异不显著,说明获得的核心种质资源能够充分、最大程度地代表原始种质。研究结果为白蜡种质资源的收集、保护、评价及利用提供了宝贵的理论依据和物质基础。利用17对高效引物构建了白蜡属植物SSR高通量鉴定体系,构建的40份白蜡核心种质能够最大程度的代表其遗传多样性。

关 键 词:白蜡属  种质资源  SSR标记  遗传多样性  核心种质

Construction of core collection of Fraxinus based on SSR molecular markers
YAN Liping,WU Dejun,MAO Xiuhong,YAO Junxiu,REN Fei,LI Shanwen,WANG Kaifang,WANG Yinhua,LIU Cuilan.Construction of core collection of Fraxinus based on SSR molecular markers[J].Journal of Central South Forestry University,2019(7):1-9.
Authors:YAN Liping  WU Dejun  MAO Xiuhong  YAO Junxiu  REN Fei  LI Shanwen  WANG Kaifang  WANG Yinhua  LIU Cuilan
Institution:(Shandong Provincial Academy of Forestry, Jinan 250014, Shandong, China;Shandong Provincial Key Laboratory of Forest Tree Genetic Improvement, Jinan 250014, Shandong, China)
Abstract:YAN Liping;WU Dejun;MAO Xiuhong;YAO Junxiu;REN Fei;LI Shanwen;WANG Kaifang;WANG Yinhua;LIU Cuilan(Shandong Provincial Academy of Forestry, Jinan 250014, Shandong, China;Shandong Provincial Key Laboratory of Forest Tree Genetic Improvement, Jinan 250014, Shandong, China)
Keywords:Fraxinus  germplasm resources  SSR marker  genetic diversity  core collection
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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