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猪流感病毒分离株A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)分子特性研究
作者单位:;1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所;2.上海市农业遗传育种重点实验室;3.上海海洋大学水产与生命学院
摘    要:采用套式PCR检测方法,结合鸡胚分离鉴定,从20份患呼吸道疾病猪的鼻咽拭子样品中分离到1株流感病毒。经亚型鉴定及全基因组序列分析,证实该分离株为H1N1流感病毒,命名为A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)。遗传进化分析表明该分离株与类禽猪流感病毒(Avian-Like H1N1)相似性最高。蛋白序列分析发现,该分离株具有低致病性流感病毒特征,即其HA蛋白的裂解位点为PSIQSR↓GLFGAI。此外,该基因中有7个潜在的糖基化位点,受体结合位点为108(Y)、148~152(GVTAA)、167(W)、197(H)、204~212(DQQ SLYQNA)和238~243(RDQEGR);其中225~228EQAG显示该分离株具有结合SAα2,6Gal受体的能力,证明该分离株具有感染哺乳动物的能力。同时PB2蛋白的627E、701N及NS蛋白的92D位点均证明了该分离株的低致病性和感染哺乳动物的能力。

关 键 词:猪流感病毒  类禽H1N1亚型  分子特性研究

Molecular characterization of swine influenza virus A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)
Abstract:
Keywords:
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