家蚕转录因子AP-4基因cDNA的分子克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 李佳梅,赵浩勤,张国政,夏定国,张业顺,唐顺明,沈兴家.家蚕转录因子AP-4基因cDNA的分子克隆与生物信息学分析[J].蚕业科学,2008,34(2):211-218. |
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作者姓名: | 李佳梅 赵浩勤 张国政 夏定国 张业顺 唐顺明 沈兴家 |
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作者单位: | 中国农业科学院蚕业研究所,农业部家蚕生物技术重点开放实验室,江苏,镇江,212018;江苏科技大学,江苏,镇江,212003;中国农业科学院蚕业研究所,农业部家蚕生物技术重点开放实验室,江苏,镇江,212018;江苏科技大学,江苏,镇江,212003 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划"863"项目
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江苏省自然科学基金前期预研重大项目 |
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摘 要: | AP-4(activator protein 4)是一种转录因子,在生物的生长发育中有重要作用。根据家蚕表达序列标签(EST)并利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法克隆了家蚕AP-4(Bombyx mori activator protein4)基因,结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,预测了AP-4蛋白的理化性质。获得的家蚕AP-4基因cDNA的全长为1621bp,其开放阅读框为996bp,编码331个氨基酸,基因由3个外显子和2个内含子组成。同源性比对表明该基因推导的氨基酸序列与棉铃虫AP-4和谷蛀虫AP-4推测的蛋白同源性分别为76%和54%,第45-99位氨基酸序列是一个典型的保守结构域。实时定量RT-PCR显示该基因在所检测家蚕的各发育时期中,除幼虫1龄和蛹期第4天无表达外,其它时期均有表达,其中幼虫3龄和4龄期的表达量较高。
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关 键 词: | 家蚕 转录因子AP-4 cDNA末端快速扩增 基因克隆 生物信息学 |
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