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WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析
引用本文:刘庆慧,黄倢,韩文君.WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析[J].海洋水产研究,2005,26(4):1-7.
作者姓名:刘庆慧  黄倢  韩文君
作者单位:中国水产科学研究院,黄海水产研究所,青岛,266071
基金项目:国家重点基础研究项目(G1999012002)、国家自然科学基金(30271020)和中国水产科学研究院项目(2003-4-1)共同资助
摘    要:运用EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite)的CHIPS(Condon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP(Create a condon usage table)程序对WSSV3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,WSSV—vp37、WSSV—vp39及WSSV—vp19的Nc(Effective number of condons)值为49.897、48.640、46.868。3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,分析结果表明,WSSVvp37和WSSV—vp39的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而WSSV—vp19的密码子与原核和真核生物酵母相差较大。

关 键 词:WSSV  密码子  偏爱性
文章编号:1000-7075(2005)04-0001-07
收稿时间:2005-01-05
修稿时间:2005-04-28

Condon preference analysis of three proteins of WSSV
LIU Qing-hui,HUANG Jie,Han Wen-jun.Condon preference analysis of three proteins of WSSV[J].Marine Fisheries Research,2005,26(4):1-7.
Authors:LIU Qing-hui  HUANG Jie  Han Wen-jun
Abstract:
Keywords:WSSV Condon Preference
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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