黄瓜绿斑驳花叶病毒北京和山东分离物的生物学测定及其基因组比较 |
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引用本文: | 田永蕾,刘冬梅,张永江,李明福,马占鸿.黄瓜绿斑驳花叶病毒北京和山东分离物的生物学测定及其基因组比较[J].中国农学通报,2009(6). |
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作者姓名: | 田永蕾 刘冬梅 张永江 李明福 马占鸿 |
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作者单位: | 田永蕾,刘冬梅,马占鸿(中国农业大学农学与生物技术学院,北京,100193);张永江,李明福(中国检验检疫科学研究院,北京)? |
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基金项目: | 黄瓜绿斑驳花叶病毒疫情防控? |
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摘 要: | 为揭示黄瓜绿斑驳花叶病毒的分子流行学特征,通过RT-PCR和cDNA克隆技术获得并分析了从北京甜瓜和山东西瓜上分离的2个黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)分离物CGMMV-Beijing和CGMMV-Shandong的全序列.结果表明CGMMV-Beijing和CGMMV-Shandong的基因组分别由6423和6427个核苷酸组成,包括5'及3'端非编码区和4个开放性的阅读框,分别编码129kDa和186kDa复制相关蛋白、29kDa的移动蛋白及17.4kDa的外壳蛋白.寄主范围测定显示在供试的6科11种植物中CGMMV-Beijing和CGMMV-Shandong均可侵染葫芦科的葫芦、南瓜和西瓜以及茄科的本氏烟和藜科的苋色藜,不侵染供试的其它植物.CGMMV-Beijing和CGMMV-Shandong基因组的核苷酸同源性为99.5%,186kDa蛋白的核酸和氨基酸同源性分别为99.7%和99.8%,移动蛋白的核酸和氨基酸同源性分别为99.3%和98.1%,外壳蛋白的核苷酸同源性为100%.多序列比对分析结果显示,CGMMV的各分离物之间的分子差异并不明显,核苷酸同源性均在98%以上.将CGMMV-Beijing和CGMMV-Shandong与侵染葫芦科植物的烟草花叶病毒属其它成员比较,结果显示其亲缘关系较远,基因组的核苷酸同源性介于56.7%~59.6%,外壳蛋白的氨基酸同源性在44.7%~54.0%之间.综合分析显示,CGMMV分离物之间的差异并不明显,可能具有共同的侵染来源.
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关 键 词: | 黄瓜绿斑驳花叶病毒 序列分析 基因组 |
Bioassay and genomic studies on the two isolates of Cucumber green mottle mosaic virus from Beijing and Shandong |
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